114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0059 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0059  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 61 aa  126  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0086  hipB protein, putative  93.44 
 
 		 61 aa  120  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0162  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  35.71 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  41.18 
 
 		 509 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  47.92 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  38.18 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  41.82 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 185 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 915 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3863  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  43.18 
 
 		 507 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.640494  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4356  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.623586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  31.58 
 
 		 513 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  41.67 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  42.31 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 67 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  39.62 
 
 		 81 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0029  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 855 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 208 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 63 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 67 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 182 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 70 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  45.1 
 
 		 184 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15930  predicted transcriptional regulator  33.9 
 
 		 72 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000543618  hitchhiker  0.000000237472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 256 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  44 
 
 		 354 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3647  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 507 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 806 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  44 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  46 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  39.22 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  39.22 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  39.22 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  39.22 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  39.22 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.78 
 
 		 517 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.55 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0878  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  39.22 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>