94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15930 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_15930  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 72 aa  147  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000543618  hitchhiker  0.000000237472 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 312 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15940  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0473945  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  34.55 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 261 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 322 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 362 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 327 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 364 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  36.67 
 
 		 301 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 459 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  34.48 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.59 
 
 		 368 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  37.31 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 123 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 188 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0059  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 61 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 204 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  36.07 
 
 		 377 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  0.0000852105 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  32.76 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 328 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  38.46 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 372 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 320 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0086  hipB protein, putative  33.9 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6277  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 380 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 231 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>