More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS0956 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  100 
 
 
92 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  98.86 
 
 
149 aa  178  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.16919e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  97.73 
 
 
149 aa  175  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  96.59 
 
 
149 aa  174  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  96.59 
 
 
149 aa  174  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.14379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  96.59 
 
 
149 aa  173  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.85883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  94.32 
 
 
149 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  2.09993e-08 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  68.48 
 
 
143 aa  127  5e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  52.31 
 
 
196 aa  80.9  6e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.0134e-07 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
206 aa  73.6  9e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 
192 aa  73.6  9e-13  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  47.5 
 
 
134 aa  73.6  1e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  50 
 
 
200 aa  73.2  1e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 
107 aa  72  2e-12  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  47.56 
 
 
334 aa  72.4  2e-12  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  7.90722e-13 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 
322 aa  72  3e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  43.04 
 
 
312 aa  69.7  1e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.89 
 
 
142 aa  70.1  1e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
63 aa  69.3  2e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  39.02 
 
 
186 aa  68.9  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  43.66 
 
 
328 aa  68.6  3e-11  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 
364 aa  68.6  3e-11  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  41.67 
 
 
146 aa  67.8  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  46.27 
 
 
145 aa  67.8  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 
183 aa  67.4  6e-11  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 
204 aa  67  8e-11  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 
327 aa  65.1  3e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  44.71 
 
 
197 aa  64.7  4e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 
205 aa  64.7  4e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  42.68 
 
 
142 aa  65.1  4e-10  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
261 aa  64.3  5e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.09596e-07  hitchhiker  2.9e-14 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  44.05 
 
 
296 aa  64.3  5e-10  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 
268 aa  63.9  7e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.6802e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  40.3 
 
 
262 aa  63.5  9e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 
185 aa  63.5  1e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  34.41 
 
 
189 aa  63.5  1e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
115 aa  63.2  1e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.83783e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 
189 aa  63.5  1e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
63 aa  62.8  2e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 
262 aa  62.4  2e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  40.3 
 
 
262 aa  62.4  2e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 
262 aa  62.4  2e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  43.08 
 
 
362 aa  61.6  3e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 
380 aa  61.6  3e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  39.24 
 
 
338 aa  62  3e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 
208 aa  62  3e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.56006e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 
203 aa  61.6  4e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
395 aa  61.6  4e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  45.61 
 
 
197 aa  60.8  6e-09  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
374 aa  60.5  8e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
224 aa  60.5  8e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  33.75 
 
 
210 aa  60.5  8e-09  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.19 
 
 
459 aa  60.1  9e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
320 aa  58.9  2e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  47.69 
 
 
197 aa  58.9  2e-08  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
118 aa  59.3  2e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  35.87 
 
 
189 aa  59.3  2e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
273 aa  58.5  3e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
64 aa  58.2  4e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 
210 aa  57.4  6e-08  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  37.68 
 
 
374 aa  57.4  6e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  37.68 
 
 
374 aa  57.4  6e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  36.11 
 
 
293 aa  57.4  7e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.39653e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
178 aa  56.2  1e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 
123 aa  56.2  1e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.12762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 
68 aa  55.8  2e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
71 aa  55.8  2e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 
361 aa  55.5  2e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  38.36 
 
 
374 aa  55.8  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
135 aa  56.2  2e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  38.36 
 
 
374 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  38.36 
 
 
374 aa  55.8  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  38.36 
 
 
374 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  34.72 
 
 
149 aa  55.8  2e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  41.18 
 
 
436 aa  55.1  3e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  34.29 
 
 
108 aa  55.1  3e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.78101e-08  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  34.67 
 
 
144 aa  55.5  3e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  34.29 
 
 
108 aa  55.5  3e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 
242 aa  55.1  3e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
71 aa  55.1  3e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 
142 aa  55.1  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
66 aa  54.7  5e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 
189 aa  54.7  5e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 
68 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
368 aa  54.7  5e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
137 aa  54.3  5e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  36.23 
 
 
374 aa  54.3  5e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  36.92 
 
 
194 aa  54.7  5e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
137 aa  53.9  6e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 
380 aa  54.3  6e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
104 aa  53.9  7e-07  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
231 aa  53.9  7e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
69 aa  53.9  7e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
65 aa  53.9  7e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  41.27 
 
 
78 aa  53.9  8e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 
115 aa  53.5  9e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.52617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 
115 aa  53.5  9e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.42648e-12  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 
163 aa  53.5  9e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.70328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
64 aa  53.5  1e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  41.94 
 
 
139 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>