More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3975 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 811 aa  1667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50.74 
 
 		 922 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.96 
 
 		 750 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  46.08 
 
 		 781 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.9 
 
 		 935 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  45.47 
 
 		 2051 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 		 937 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.22 
 
 		 945 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 		 939 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 		 784 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 721 aa  362  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 720 aa  360  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 		 989 aa  354  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 989 aa  347  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 		 865 aa  337  7e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 		 770 aa  333  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  38.75 
 
 		 1323 aa  330  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 1323 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 		 929 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1146 aa  312  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1127 aa  312  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 1322 aa  302  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 		 1285 aa  301  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 		 1068 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 		 1058 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 1178 aa  294  5e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  36.49 
 
 		 1257 aa  294  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  37.15 
 
 		 1161 aa  293  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  32.91 
 
 		 810 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 1090 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 1090 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 1195 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 1197 aa  287  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  35.89 
 
 		 1153 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 1202 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1578 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 1611 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 		 1187 aa  280  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1175 aa  279  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1126 aa  278  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 1002 aa  276  9e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  34.76 
 
 		 1128 aa  276  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 844 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 844 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  37.66 
 
 		 800 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 1122 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 1173 aa  273  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 1128 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1002 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1002 aa  271  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1130 aa  270  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  35.86 
 
 		 1132 aa  270  8e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1122 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40 
 
 		 655 aa  267  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  33.54 
 
 		 1121 aa  267  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  35.73 
 
 		 1140 aa  267  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 1124 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1099 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  37.11 
 
 		 1220 aa  265  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.78 
 
 		 1131 aa  264  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  35.92 
 
 		 1122 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  32.99 
 
 		 1125 aa  264  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 841 aa  263  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1197 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1127 aa  260  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 		 995 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  34.26 
 
 		 1211 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1154 aa  259  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  38.68 
 
 		 1028 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 765 aa  254  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  34.29 
 
 		 1170 aa  254  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 803 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.92 
 
 		 659 aa  253  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 1407 aa  252  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 865 aa  251  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  33.95 
 
 		 1166 aa  250  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 1927 aa  250  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 633 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.2 
 
 		 777 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.59 
 
 		 620 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 860 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1672 aa  249  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 		 759 aa  248  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 807 aa  248  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1113 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 1120 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  37.86 
 
 		 853 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 1193 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 1193 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  33.4 
 
 		 1071 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 827 aa  245  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 		 873 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1313 aa  244  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  33.47 
 
 		 1071 aa  243  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.87 
 
 		 763 aa  243  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 1271 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 674 aa  242  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  36.36 
 
 		 1560 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 969 aa  241  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>