59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0177 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  100 
 
 
716 aa  1456    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  37.67 
 
 
686 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0291  NHL repeat-containing protein  32.03 
 
 
669 aa  310  9e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  29.33 
 
 
680 aa  287  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1595  hypothetical protein  32.01 
 
 
540 aa  271  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  40.74 
 
 
379 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  32.19 
 
 
346 aa  65.1  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  30.88 
 
 
391 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.33 
 
 
930 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.98 
 
 
365 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  30.23 
 
 
676 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  32.94 
 
 
418 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  31.16 
 
 
307 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  21.83 
 
 
588 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  26.45 
 
 
368 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  29.13 
 
 
1030 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  23.64 
 
 
627 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  31.43 
 
 
363 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  34.38 
 
 
700 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  32.98 
 
 
347 aa  55.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.69 
 
 
522 aa  54.7  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.58 
 
 
930 aa  54.7  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  29.09 
 
 
384 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.4 
 
 
831 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  19.93 
 
 
1177 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  24.35 
 
 
752 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  29.89 
 
 
395 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  21.17 
 
 
1293 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  31.76 
 
 
1163 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  30.83 
 
 
372 aa  52  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  31.17 
 
 
1146 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.97 
 
 
709 aa  50.8  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  29.2 
 
 
343 aa  50.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  33.87 
 
 
525 aa  50.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 
396 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  27.32 
 
 
668 aa  49.3  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  28.74 
 
 
355 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  30 
 
 
360 aa  47.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.91 
 
 
343 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  25.47 
 
 
364 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  32.61 
 
 
521 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  26.62 
 
 
353 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  28.42 
 
 
436 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  29.5 
 
 
1068 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  25 
 
 
319 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  32.1 
 
 
412 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
1230 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.1 
 
 
1140 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  28.1 
 
 
361 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  24.12 
 
 
387 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  25.45 
 
 
390 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.62 
 
 
1834 aa  45.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.03 
 
 
1079 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.45 
 
 
579 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.26 
 
 
1026 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  24.63 
 
 
354 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  28.35 
 
 
630 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  25 
 
 
664 aa  43.9  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
850 aa  43.9  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>