More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2545 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  324  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  82.61 
 
 
152 aa  229  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  44.44 
 
 
139 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0053  transcriptional regulator, MarR family  43.23 
 
 
198 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  43.12 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  38.75 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.75 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.38 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  37.08 
 
 
139 aa  54.7  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  37.08 
 
 
139 aa  54.3  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 
151 aa  54.3  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
146 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
150 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 
153 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.71 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.27 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  26.77 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.97 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  32.43 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  37.5 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 
146 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>