More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0717 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  100 
 
 		 226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  82.08 
 
 		 232 aa  335  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  54.11 
 
 		 686 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  52.66 
 
 		 703 aa  201  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  54.03 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  53.77 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  51.46 
 
 		 901 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  52.68 
 
 		 688 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 705 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  47.06 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  54.17 
 
 		 686 aa  191  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  50.73 
 
 		 707 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  54.42 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  51.5 
 
 		 688 aa  188  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  52.4 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  54.15 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  51.47 
 
 		 671 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  58.29 
 
 		 662 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  48.06 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  47.45 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  45.85 
 
 		 219 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  49.09 
 
 		 707 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  49.52 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  50 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  46.31 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  52.41 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  46.35 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  51.11 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  44.2 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  43.72 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.66 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  49.15 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  45.74 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  44.29 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43.75 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.2 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  48.76 
 
 		 281 aa  158  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.74 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  39.3 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  42.47 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 203 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 295 aa  156  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.33 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  48.3 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.87 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  46.49 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  37.11 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  43.93 
 
 		 209 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  41.36 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  47.87 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  39.81 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  40.82 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  38.6 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  40.39 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  38.24 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  40.84 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.68 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  40.84 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  46.03 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  45.5 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  43.5 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  45.92 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  42.02 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  39.38 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  43.62 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  44.74 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 204 aa  149  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 200 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  44.97 
 
 		 205 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 233 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  46.03 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  43.37 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  46.81 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  38.76 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  46.52 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  38.76 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>