101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3123 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  100 
 
 		 1392 aa  2678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  40.92 
 
 		 1308 aa  370  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1073 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.68 
 
 		 1583 aa  171  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.6 
 
 		 1609 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 		 1078 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 973 aa  155  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  32.03 
 
 		 1344 aa  155  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  31.05 
 
 		 1157 aa  153  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.69 
 
 		 1598 aa  153  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.38 
 
 		 1599 aa  149  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 		 1190 aa  148  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 		 972 aa  148  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1491 aa  147  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  31.95 
 
 		 1334 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 		 239 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411546  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.17 
 
 		 1547 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.38 
 
 		 1398 aa  143  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  29.95 
 
 		 1152 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.44 
 
 		 1236 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.13 
 
 		 1711 aa  141  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.31 
 
 		 1607 aa  139  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  32.94 
 
 		 1699 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  32.63 
 
 		 1265 aa  136  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.39 
 
 		 1823 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 		 1013 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.44 
 
 		 1686 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.86 
 
 		 1623 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  27.88 
 
 		 902 aa  128  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 1353 aa  128  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 		 1760 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.93 
 
 		 1626 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  34.81 
 
 		 1355 aa  126  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 1014 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.3 
 
 		 1481 aa  125  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 969 aa  124  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 969 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  30.75 
 
 		 897 aa  124  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 901 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  30.02 
 
 		 1005 aa  123  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1553 aa  122  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 1032 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.28 
 
 		 1267 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  29.35 
 
 		 1301 aa  122  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 		 965 aa  121  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 		 1020 aa  121  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.69 
 
 		 1357 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 		 1046 aa  119  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.22 
 
 		 1240 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1657 aa  116  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1510 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.39 
 
 		 1617 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 885 aa  115  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  30.06 
 
 		 1399 aa  109  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.07 
 
 		 1684 aa  109  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1026 aa  108  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  24.47 
 
 		 1102 aa  107  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  26.25 
 
 		 1075 aa  105  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  32.3 
 
 		 1194 aa  105  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  29.87 
 
 		 1074 aa  105  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  25.61 
 
 		 1067 aa  105  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  34.09 
 
 		 994 aa  104  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  25.8 
 
 		 1089 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 1080 aa  103  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.35 
 
 		 1075 aa  102  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  25.61 
 
 		 1089 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  25.75 
 
 		 1075 aa  102  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  26.21 
 
 		 1124 aa  102  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.35 
 
 		 1063 aa  102  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1230 aa  101  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  28.32 
 
 		 1733 aa  101  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  26.24 
 
 		 1092 aa  100  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  24.62 
 
 		 1092 aa  98.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 		 1314 aa  97.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 947 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  26.32 
 
 		 1131 aa  96.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  29.91 
 
 		 787 aa  93.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  33.26 
 
 		 1085 aa  93.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  31.87 
 
 		 1401 aa  84  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1432 aa  82.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1733  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.57 
 
 		 643 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  28.88 
 
 		 1424 aa  77.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2530  hypothetical protein  34.5 
 
 		 521 aa  78.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  36.47 
 
 		 1766 aa  78.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 		 1152 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.38 
 
 		 1211 aa  64.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  25.43 
 
 		 1264 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  25.43 
 
 		 1264 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 		 698 aa  62.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5277  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic contain C-terminal PDZ domain-like protein  24.48 
 
 		 425 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6476  serine/threonine protein kinase  38.67 
 
 		 1187 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6921  hypothetical protein  50.88 
 
 		 659 aa  55.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2814  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1043 aa  52.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0400  hypothetical protein  31.53 
 
 		 318 aa  52.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6430  pentapeptide repeat protein  36.64 
 
 		 998 aa  51.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  34.97 
 
 		 1183 aa  49.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.16 
 
 		 943 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5729  TPR repeat-containing protein  46.43 
 
 		 712 aa  46.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.61 
 
 		 357 aa  46.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 366 aa  46.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>