1276 genes were found for organism Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 13    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PICST_11143  CDS  NC_009068  3433388  3434863  -  1476  Suppressor of Sulfoxyde Ethionine resistance  XP_001387230  normal  0.015921  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11162  CDS  NC_009068  354771  356240  -  1470  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  XP_001387715  normal  1  normal  0.360349  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11262  CDS  NC_009068  2703910  2705475  -  1566  predicted protein  XP_001387085  normal  0.0642487  normal  0.387343  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12325  CDS  NC_009068  1118111  1118683  -  573  hypothetical protein  XP_001387859  normal  1  normal  0.663972  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12362  CDS  NC_009068  3455419  3456441  +  1023  conserved hypothetical protein  XP_001386991  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13471  CDS  NC_009068  1152696  1153190  +  495  RNA-binding protein  XP_001387451  normal  1  normal  0.0775963  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17370  CDS  NC_009068  3405186  3406763  +  1578  Apoptosis antagonizing transcription factor  XP_001386978  normal  0.490747  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17616  CDS  NC_009068  307132  311502  +  4371  hyphally regulated cell wall protein  XP_001387297  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19384  CDS  NC_009068  2731372  2732706  +  1335  predicted protein  XP_001386853  normal  1  normal  0.250044  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23033  CDS  NC_009068  1846807  1847103  +  297  predicted protein  XP_001387593  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23499  CDS  NC_009068  3015399  3015743  +  345  predicted protein  XP_001386906  normal  1  normal  0.961342  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23779  CDS  NC_009068  1445438  1445692  +  255  Nonhistone chromosomal protein 6A  XP_001387507  normal  0.667446  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23872  CDS  NC_009068  899639  899818  -  180  60S ribosomal protein L29  XP_001387811  normal  1  normal  0.710722  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_24134  CDS  NC_009068  2956771  2960040  +  3270  predicted protein  XP_001386899  normal  1  hitchhiker  0.00000713013  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_24555  CDS  NC_009068  109704  111488  -  1785  predicted protein  XP_001387677  normal  0.159857  normal  0.274534  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_25832  CDS  NC_009068  1719857  1721119  -  1263  cell wall protein in family of putative glycosidases Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase  XP_001387970  normal  0.623887  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_2658  CDS  NC_009068  2920953  2922305  -  1353  NAD-dependent histone deacetylase  XP_001387128  normal  0.755641  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_26814  CDS  NC_009068  3007378  3008133  -  756  predicted protein  XP_001387142  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_26963  CDS  NC_009068  900810  901568  -  759  60S ribosomal protein L7A  XP_001387812  normal  1  normal  0.546499  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27132  CDS  NC_009068  956392  957018  -  627  hypothetical protein  XP_001387818  normal  1  normal  0.351185  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27915  CDS  NC_009068  3200627  3200851  +  225  Putative cytochrome c oxidase, subunit COX19  XP_001386938  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27987  CDS  NC_009068  1841  8191  +  6351  vesicle coat complex AP-3  XP_001387243  normal  0.643082  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27988  CDS  NC_009068  10549  14520  +  3972  vesicle coat complex AP-3  XP_001387244  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27989  CDS  NC_009068  14883  16892  +  2010  ATP-dependent DNA helicase  XP_001387245  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27997  CDS  NC_009068  46276  47814  +  1539  predicted protein  XP_001387248  normal  1  normal  0.0549908  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28000  CDS  NC_009068  49800  52376  +  2577  Fungal-specific transcription factor  XP_001387250  normal  0.395949  normal  0.0721946  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28003  CDS  NC_009068  59667  61528  -  1862  putative RNA-directed DNA polymerase  XP_001387666  normal  1  normal  0.658129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28004  CDS  NC_009068  62072  63316  -  1245  hypothetical multi-copy protein  XP_001387667  normal  0.118881  normal  0.632986  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28027  CDS  NC_009068  126494  128043  -  1550  predicted protein  XP_001387680  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28028  CDS  NC_009068  128286  128633  -  348  predicted protein  XP_001387681  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28031  CDS  NC_009068  141099  143129  +  2031  predicted protein  XP_001387262  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28032  CDS  NC_009068  145165  146502  +  1338  predicted protein  XP_001387263  normal  0.112466  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28046  CDS  NC_009068  181411  182124  -  714  predicted protein  XP_001387686  normal  0.18282  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28080  CDS  NC_009068  263180  263869  -  690  predicted protein  XP_001387700  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28093  CDS  NC_009068  298557  299039  -  483  predicted protein  XP_001387706  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28094  CDS  NC_009068  299893  302355  -  2463  activator of transcription of nitrogen-regulated genes  XP_001387707  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28097  CDS  NC_009068  316312  317199  +  888  Suppressor of mutant AC40 subunit of RNA polymerase I and III (high serine)  XP_001387299  normal  1  normal  0.371029  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28102  CDS  NC_009068  328667  329242  -  576  predicted protein  XP_001387711  normal  1  normal  0.490361  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28111  CDS  NC_009068  347837  351421  -  3585  Zn-finger protein  XP_001387714  normal  1  normal  0.689755  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28119  CDS  NC_009068  373685  377962  +  4278  Suppressor of Sensor Kinase (SLN1)  XP_001387312  normal  1  normal  0.261417  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28122  CDS  NC_009068  384411  386369  +  1959  nuclear localization sequence binding protein  XP_001387313  normal  1  normal  0.0434599  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28128  CDS  NC_009068  405717  406589  -  873  predicted protein  XP_001387721  normal  0.401737  normal  0.0860362  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28132  CDS  NC_009068  417208  417846  -  639  phosphatidylinositol synthase  XP_001387722  normal  1  normal  0.619902  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28136  CDS  NC_009068  428375  429757  +  1383  predicted protein  XP_001387321  normal  0.268388  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28139  CDS  NC_009068  437339  440071  -  2733  Putative serine proteinase inhibitor (KU family)  XP_001387724  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28145  CDS  NC_009068  460165  461739  +  1575  predicted protein  XP_001387326  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28157  CDS  NC_009068  492224  494146  +  1923  putative flavin-containing monooxygenase  XP_001387331  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28162  CDS  NC_009068  504149  505276  -  1128  Gamma tubulin  XP_001387736  normal  0.0897404  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28167  CDS  NC_009068  526746  527153  -  408  predicted protein  XP_001387739  normal  1  normal  0.994579  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28175  CDS  NC_009068  546416  546940  +  525  Sporulation-specific protein 73  XP_001387337  normal  0.0802916  normal  0.637046  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28177  CDS  NC_009068  549630  551279  +  1650  component of chaperonin-containing T-complex  XP_001387338  normal  0.474469  normal  0.235435  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28179  CDS  NC_009068  552342  554675  -  2334  protein required for protein sorting at the late Golgi  XP_001387747  normal  1  normal  0.665656  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28181  CDS  NC_009068  560612  561037  +  426  predicted protein  XP_001387340  normal  0.899945  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28186  CDS  NC_009068  573197  574015  -  819  predicted protein  XP_001387750  normal  1  normal  0.588092  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28187  CDS  NC_009068  575780  576577  -  798  cell wall integrity and stress response component 3  XP_001387751  normal  1  normal  0.238629  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28190  CDS  NC_009068  584270  586303  -  2034  predicted protein  XP_001387753  normal  0.458855  normal  0.78983  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28198  CDS  NC_009068  604992  605372  +  381  predicted protein  XP_001387347  normal  0.712661  normal  0.0339659  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28199  CDS  NC_009068  607037  607372  +  336  predicted protein  XP_001387348  normal  1  decreased coverage  0.00737399  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28220  CDS  NC_009068  664382  666736  -  2355  Halotolerance protein HAL3 (contains flavoprotein domain)  XP_001387767  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28221  CDS  NC_009068  668822  670501  +  1680  aldehyde dehydrogenase  XP_001387358  normal  1  normal  0.272017  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28222  CDS  NC_009068  670988  672145  -  1158  protein involved in the diauxic switch  XP_001387768  normal  1  normal  0.230567  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28225  CDS  NC_009068  681834  682217  -  384  predicted protein  XP_001387770  normal  1  normal  0.0672955  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28227  CDS  NC_009068  685674  686189  +  516  protein involved in toxin resistance  XP_001387360  normal  1  normal  0.52679  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28228  CDS  NC_009068  686737  691563  +  4827  separin protein  XP_001387361  normal  1  normal  0.322437  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28231  CDS  NC_009068  697533  699668  +  2136  predicted protein  XP_001387363  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28236  CDS  NC_009068  711792  712945  +  1154  predicted protein  XP_001387365  normal  0.410735  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28237  CDS  NC_009068  713296  714147  -  852  predicted protein  XP_001387775  normal  0.326366  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28240  CDS  NC_009068  720126  720647  +  522  RNA polymerase II subunit  XP_001387367  normal  0.18212  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28241  CDS  NC_009068  720870  725801  -  4932  hypothetical protein  XP_001387777  normal  0.531382  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28250  CDS  NC_009068  751270  754485  -  3216  predicted protein  XP_001387783  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28253  CDS  NC_009068  762593  764152  +  1560  Yeast Sphingolipid Resistance Gene  XP_001387372  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28260  CDS  NC_009068  777950  779050  +  1101  predicted protein  XP_001387378  normal  0.295741  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28263  CDS  NC_009068  782497  783513  -  1017  thioredoxin  XP_001387786  normal  0.135642  normal  0.918036  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28267  CDS  NC_009068  790255  791664  -  1410  transactivator protein  XP_001387788  normal  1  normal  0.285828  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28269  CDS  NC_009068  793149  795083  -  1935  conserved hypothetical protein, located in mitochondrion  XP_001387789  normal  0.661194  normal  0.381664  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28271  CDS  NC_009068  797782  799914  -  2133  Rac GTPase-activating protein BCR/ABR  XP_001387791  normal  0.692213  normal  0.257016  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28281  CDS  NC_009068  832001  833662  +  1662  predicted protein  XP_001387388  normal  1  normal  0.533731  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28287  CDS  NC_009068  853129  854673  -  1545  putative transporter or flippase transmembrane protein  XP_001387796  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28288  CDS  NC_009068  856123  858552  -  2430  cyclin like protein interacting with PHO85  XP_001387797  normal  1  normal  0.840932  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28308  CDS  NC_009068  892771  895233  -  2463  putative part of mitochondrial translation system  XP_001387809  normal  1  normal  0.953702  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28309  CDS  NC_009068  896169  897433  +  1265  60S large subunit ribosomal protein L2A  XP_001387403  normal  1  normal  0.24055  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28310  CDS  NC_009068  897603  899051  -  1449  single stranded nucleic acid binding protein  XP_001387810  normal  1  normal  0.635098  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28317  CDS  NC_009068  910483  911931  -  1449  AP endonuclease  XP_001387814  normal  1  normal  0.563607  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28326  CDS  NC_009068  941218  941769  +  552  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  XP_001387414  normal  0.493864  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28329  CDS  NC_009068  946981  948777  +  1797  mitochondrial outer membrane protein involved in mitochondrial shape  XP_001387416  normal  0.863481  normal  0.640618  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28339  CDS  NC_009068  967388  969067  -  1680  hypothetical protein  XP_001387823  normal  0.908779  normal  0.0915689  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28340  CDS  NC_009068  969415  971529  -  2115  Leucine rich repeat protein  XP_001387824  normal  0.669391  normal  0.295604  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28344  CDS  NC_009068  981115  981816  -  702  predicted protein  XP_001387828  normal  1  normal  0.872469  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28349  CDS  NC_009068  993696  994910  -  1215  hypothetical protein  XP_001387831  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28353  CDS  NC_009068  1006031  1007581  -  1551  hypothetical protein  XP_001387833  normal  0.104804  normal  0.672282  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28358  CDS  NC_009068  1021727  1022746  -  1020  RNA pol II transcription cofactor  XP_001387838  normal  1  normal  0.155514  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28360  CDS  NC_009068  1025005  1026225  +  1221  ssDNA endonuclease and repair protein  XP_001387425  normal  1  normal  0.0530597  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28363  CDS  NC_009068  1028794  1030587  -  1794  chromatin remodeling protein  XP_001387841  normal  1  normal  0.118968  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28367  CDS  NC_009068  1038085  1039371  -  1287  myosin-like protein  XP_001387843  normal  0.525338  normal  0.0889168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28372  CDS  NC_009068  1051693  1052916  -  1224  leucyl aminopeptidase precursor  XP_001387847  normal  1  normal  0.36652  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28380  CDS  NC_009068  1071192  1072331  +  1140  predicted protein  XP_001387434  normal  0.204558  normal  0.767485  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28386  CDS  NC_009068  1088057  1093147  -  5091  RAP1-interacting factor, involved in establishment of repressed chromatin  XP_001387854  normal  1  normal  0.982301  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28388  CDS  NC_009068  1096265  1096903  -  639  conserved hypothetical protein  XP_001387856  normal  0.706106  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28392  CDS  NC_009068  1101228  1103089  +  1862  putative RNA-directed DNA polymerase  XP_001387439  normal  0.97685  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_28393  CDS  NC_009068  1105477  1107840  +  2364  histone acetyltransferase SAGA complex member  XP_001387440  normal  0.3451  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 13    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>