216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28177 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  55.73 
 
 		 581 aa  651    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  100 
 
 		 549 aa  1111    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  53.25 
 
 		 547 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  46.55 
 
 		 541 aa  486  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40956  predicted protein  42.23 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  34.18 
 
 		 543 aa  297  3e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  32.35 
 
 		 543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  31.94 
 
 		 545 aa  280  5e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  30.68 
 
 		 542 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  30.68 
 
 		 542 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  32 
 
 		 543 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  30.88 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  32.27 
 
 		 563 aa  263  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  31.56 
 
 		 551 aa  263  6e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  30.75 
 
 		 553 aa  259  7e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  30.51 
 
 		 542 aa  259  8e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  28.93 
 
 		 555 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  30.02 
 
 		 559 aa  250  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  30.22 
 
 		 558 aa  249  8e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  29.35 
 
 		 543 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  30.3 
 
 		 551 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  29.31 
 
 		 558 aa  246  8e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  29.17 
 
 		 539 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  30.8 
 
 		 560 aa  244  3e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.74 
 
 		 551 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  31.74 
 
 		 558 aa  243  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  30.77 
 
 		 554 aa  243  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  30.44 
 
 		 553 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.21 
 
 		 555 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  28.77 
 
 		 558 aa  240  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  29.74 
 
 		 500 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  29.17 
 
 		 559 aa  239  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  30.26 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  28.87 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  29.59 
 
 		 554 aa  233  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  29.35 
 
 		 553 aa  233  5e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  29.98 
 
 		 547 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  30.36 
 
 		 561 aa  233  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  27.95 
 
 		 563 aa  233  8.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  29.08 
 
 		 560 aa  232  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  30.63 
 
 		 548 aa  231  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  29.47 
 
 		 541 aa  229  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  29.46 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  28.66 
 
 		 553 aa  227  4e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  28.4 
 
 		 552 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.96 
 
 		 546 aa  226  8e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  26.35 
 
 		 570 aa  223  7e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.12 
 
 		 537 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  28.16 
 
 		 552 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  28.76 
 
 		 570 aa  219  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  28.62 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  27.79 
 
 		 547 aa  216  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.1 
 
 		 530 aa  216  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  28.21 
 
 		 548 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  29.91 
 
 		 558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  27.95 
 
 		 577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  28.63 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  28.63 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  29.51 
 
 		 542 aa  214  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  27.34 
 
 		 557 aa  213  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  27.74 
 
 		 536 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  27.84 
 
 		 540 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.54 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  28.66 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  27.64 
 
 		 560 aa  207  5e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  28.4 
 
 		 554 aa  206  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  27.52 
 
 		 527 aa  205  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  28.54 
 
 		 550 aa  205  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  29.98 
 
 		 551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  26.57 
 
 		 535 aa  201  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.6 
 
 		 529 aa  200  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  26.13 
 
 		 536 aa  200  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  26.97 
 
 		 541 aa  200  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  30.83 
 
 		 542 aa  199  7e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  28.74 
 
 		 533 aa  199  9e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.15 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.63 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  29.35 
 
 		 548 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.4 
 
 		 525 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.85 
 
 		 532 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  26.87 
 
 		 527 aa  196  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  27.78 
 
 		 527 aa  195  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  26.87 
 
 		 538 aa  193  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  27.06 
 
 		 553 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  27.2 
 
 		 550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  26.69 
 
 		 568 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  26.61 
 
 		 529 aa  190  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  27.43 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  25.36 
 
 		 559 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  26.35 
 
 		 567 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  26.86 
 
 		 528 aa  187  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  25.98 
 
 		 548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  27.22 
 
 		 530 aa  180  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.42 
 
 		 528 aa  180  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  26.67 
 
 		 546 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  26.44 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  25.2 
 
 		 523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  26.91 
 
 		 526 aa  163  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  24.43 
 
 		 558 aa  157  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  23.65 
 
 		 552 aa  151  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>