More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3659 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  92.51 
 
 
557 aa  967    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  77.69 
 
 
559 aa  803    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  78.23 
 
 
563 aa  797    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  74.81 
 
 
558 aa  768    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  58.23 
 
 
543 aa  637    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  100 
 
 
558 aa  1076    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  61.03 
 
 
551 aa  640    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  58.78 
 
 
542 aa  627  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  61.03 
 
 
551 aa  627  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  61.03 
 
 
552 aa  624  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  57.31 
 
 
555 aa  619  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  59.61 
 
 
543 aa  616  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  61.33 
 
 
553 aa  617  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  59.03 
 
 
542 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  58.64 
 
 
545 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  59.58 
 
 
552 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  58.83 
 
 
542 aa  610  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  54.66 
 
 
543 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  57.06 
 
 
543 aa  600  1e-170  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  55.17 
 
 
551 aa  586  1e-166  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  55.94 
 
 
547 aa  580  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  58.03 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  55.47 
 
 
539 aa  570  1e-161  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  55.58 
 
 
554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  56.69 
 
 
561 aa  550  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  50.48 
 
 
560 aa  532  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  54.91 
 
 
548 aa  523  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  50.29 
 
 
570 aa  523  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  51.91 
 
 
500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  49.9 
 
 
545 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  49.71 
 
 
553 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.63 
 
 
546 aa  512  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  48.66 
 
 
540 aa  510  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  52.51 
 
 
555 aa  504  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  46.3 
 
 
557 aa  500  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  46.82 
 
 
554 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  50.29 
 
 
541 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  53.07 
 
 
525 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  48.76 
 
 
548 aa  490  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  48.3 
 
 
558 aa  485  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  48.26 
 
 
560 aa  482  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.62 
 
 
529 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  46.33 
 
 
553 aa  481  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.9 
 
 
519 aa  481  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.36 
 
 
530 aa  478  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.59 
 
 
527 aa  476  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  46.24 
 
 
547 aa  473  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  47.05 
 
 
554 aa  473  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.23 
 
 
536 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  52.44 
 
 
525 aa  474  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.45 
 
 
532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.91 
 
 
528 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  47.72 
 
 
549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  48.18 
 
 
550 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  46.24 
 
 
559 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  47.64 
 
 
553 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  47.61 
 
 
554 aa  466  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  45.42 
 
 
562 aa  456  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  43.21 
 
 
558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.36 
 
 
537 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  43.24 
 
 
528 aa  410  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  39.23 
 
 
538 aa  401  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  36.68 
 
 
527 aa  385  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  40 
 
 
535 aa  374  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  37.5 
 
 
559 aa  373  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  37.43 
 
 
567 aa  371  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  39.88 
 
 
535 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  40.92 
 
 
542 aa  365  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  37.04 
 
 
553 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  37.04 
 
 
553 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  39.63 
 
 
553 aa  353  5.9999999999999994e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  38.53 
 
 
550 aa  351  2e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  38.31 
 
 
558 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  37.83 
 
 
541 aa  343  5e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  36.61 
 
 
527 aa  340  5e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  36.24 
 
 
529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.82 
 
 
570 aa  337  5e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  36.49 
 
 
542 aa  336  7e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  37.19 
 
 
536 aa  335  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  36.04 
 
 
536 aa  332  9e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  37.14 
 
 
563 aa  332  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  36.57 
 
 
548 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  36.89 
 
 
568 aa  325  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  35.76 
 
 
533 aa  325  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  38.11 
 
 
548 aa  325  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  35.42 
 
 
577 aa  322  9.999999999999999e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.94 
 
 
560 aa  318  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  37.48 
 
 
551 aa  314  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  34.72 
 
 
530 aa  286  5e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  33.85 
 
 
541 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.87 
 
 
531 aa  280  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  35.16 
 
 
534 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  35.16 
 
 
534 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  33.03 
 
 
539 aa  273  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.66 
 
 
523 aa  273  6e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  33.79 
 
 
547 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.18 
 
 
564 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  34.02 
 
 
552 aa  269  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  33.65 
 
 
546 aa  268  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  31.56 
 
 
558 aa  264  3e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>