More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2113 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  100 
 
 
546 aa  1049    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  54.44 
 
 
559 aa  531  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  52.78 
 
 
557 aa  526  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  53.77 
 
 
558 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  53.79 
 
 
563 aa  514  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  52.17 
 
 
558 aa  484  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  47.09 
 
 
543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  47.55 
 
 
543 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  46.52 
 
 
554 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  46.21 
 
 
543 aa  455  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  49.16 
 
 
552 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  48.54 
 
 
561 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  45.75 
 
 
555 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  46.53 
 
 
542 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  46.08 
 
 
543 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  46.72 
 
 
552 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  45.25 
 
 
542 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  46.62 
 
 
551 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  45.25 
 
 
542 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  45.25 
 
 
545 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  46.89 
 
 
551 aa  445  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  46.62 
 
 
539 aa  441  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  47.49 
 
 
553 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  47.13 
 
 
548 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  46.24 
 
 
551 aa  432  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.24 
 
 
555 aa  425  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  45.09 
 
 
552 aa  420  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  43.2 
 
 
553 aa  412  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  43.82 
 
 
547 aa  410  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  42.64 
 
 
560 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  47 
 
 
525 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  42.59 
 
 
545 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  42.57 
 
 
557 aa  398  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.01 
 
 
528 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  44.11 
 
 
548 aa  387  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  39.4 
 
 
540 aa  387  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.51 
 
 
532 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.61 
 
 
519 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  41.8 
 
 
500 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  43.69 
 
 
541 aa  380  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  39.41 
 
 
570 aa  380  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.87 
 
 
525 aa  379  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  40 
 
 
537 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  40.26 
 
 
553 aa  378  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.42 
 
 
530 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.84 
 
 
536 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.39 
 
 
527 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  41.08 
 
 
558 aa  374  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  43.93 
 
 
550 aa  370  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  39.12 
 
 
559 aa  366  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  38.83 
 
 
547 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  43.07 
 
 
549 aa  367  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  40.64 
 
 
554 aa  368  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  43.74 
 
 
554 aa  367  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  39.89 
 
 
560 aa  365  2e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.1 
 
 
529 aa  364  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  39.41 
 
 
554 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  38.67 
 
 
558 aa  359  7e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  39.77 
 
 
553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  38.36 
 
 
562 aa  357  3.9999999999999996e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  36.77 
 
 
528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  35.2 
 
 
553 aa  306  9.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  32.6 
 
 
538 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  36.7 
 
 
542 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  34.69 
 
 
542 aa  296  9e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  36.9 
 
 
551 aa  295  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  31.8 
 
 
527 aa  293  5e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  32.92 
 
 
559 aa  293  6e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  34.42 
 
 
535 aa  292  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  33.15 
 
 
570 aa  290  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  34.77 
 
 
558 aa  289  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  34.25 
 
 
568 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  33.46 
 
 
535 aa  287  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.27 
 
 
560 aa  286  9e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 
567 aa  282  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  32.47 
 
 
541 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  33.14 
 
 
533 aa  280  4e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  34.01 
 
 
550 aa  280  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  33.14 
 
 
527 aa  279  7e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  34.08 
 
 
577 aa  279  9e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  32.65 
 
 
536 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  33.39 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  33.39 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  33.15 
 
 
563 aa  274  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  31.84 
 
 
548 aa  274  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  31.49 
 
 
529 aa  273  8.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  32.1 
 
 
536 aa  269  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  33.21 
 
 
548 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  32.96 
 
 
530 aa  253  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  32.51 
 
 
523 aa  248  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.27 
 
 
564 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  31.25 
 
 
541 aa  233  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  32.82 
 
 
531 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  31.6 
 
 
534 aa  232  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  31.6 
 
 
534 aa  232  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  30.98 
 
 
546 aa  227  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  30.57 
 
 
539 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  28.96 
 
 
549 aa  223  7e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  28.86 
 
 
558 aa  223  9e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40956  predicted protein  30.95 
 
 
529 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>