More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0199 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  62.38 
 
 
539 aa  652    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  63.04 
 
 
543 aa  656    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  100 
 
 
552 aa  1097    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  67.59 
 
 
543 aa  717    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  68.06 
 
 
555 aa  739    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  81.13 
 
 
553 aa  818    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  60.89 
 
 
559 aa  638    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  63.04 
 
 
545 aa  659    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  82.48 
 
 
552 aa  838    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  68.5 
 
 
542 aa  746    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  62.84 
 
 
542 aa  655    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  62.84 
 
 
542 aa  659    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  83.52 
 
 
551 aa  864    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  70.24 
 
 
543 aa  747    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  71.21 
 
 
547 aa  732    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  64.19 
 
 
551 aa  674    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  83.36 
 
 
551 aa  870    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  60.42 
 
 
558 aa  631  1e-180  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  59.04 
 
 
557 aa  632  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  59.36 
 
 
543 aa  630  1e-179  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  59.31 
 
 
560 aa  625  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  59.42 
 
 
563 aa  625  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  59.85 
 
 
553 aa  618  1e-176  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  56.79 
 
 
570 aa  617  1e-175  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  61.76 
 
 
500 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  59.62 
 
 
558 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  56.07 
 
 
557 aa  596  1e-169  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  56.69 
 
 
548 aa  578  1e-164  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  55.98 
 
 
545 aa  580  1e-164  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  54.34 
 
 
554 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  53.44 
 
 
540 aa  569  1e-161  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  55 
 
 
553 aa  566  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  53.32 
 
 
554 aa  564  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  56.69 
 
 
554 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  55.77 
 
 
541 aa  559  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  55.64 
 
 
549 aa  558  1e-157  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  56.2 
 
 
550 aa  552  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  53.92 
 
 
552 aa  550  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  53.17 
 
 
561 aa  548  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  52.21 
 
 
536 aa  544  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  51.53 
 
 
559 aa  538  1e-151  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  53.21 
 
 
529 aa  531  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.12 
 
 
530 aa  531  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  51.28 
 
 
562 aa  520  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.09 
 
 
532 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  51.02 
 
 
548 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  52 
 
 
554 aa  512  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  52.02 
 
 
560 aa  513  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  51.23 
 
 
558 aa  509  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  46.84 
 
 
558 aa  505  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.1 
 
 
555 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.81 
 
 
527 aa  500  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  48.85 
 
 
547 aa  497  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  51.45 
 
 
553 aa  495  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.49 
 
 
537 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  48.88 
 
 
528 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.63 
 
 
546 aa  462  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.42 
 
 
525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.46 
 
 
519 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.45 
 
 
525 aa  435  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.04 
 
 
528 aa  428  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  39.96 
 
 
538 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  43.8 
 
 
535 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  37.43 
 
 
527 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  39.35 
 
 
559 aa  389  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  37.66 
 
 
567 aa  390  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  41.49 
 
 
535 aa  385  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  41.78 
 
 
541 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  39.07 
 
 
553 aa  376  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  39.07 
 
 
553 aa  376  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  39.89 
 
 
550 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  40.51 
 
 
527 aa  369  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  40.92 
 
 
542 aa  369  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  38.03 
 
 
563 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  39.28 
 
 
553 aa  363  5.0000000000000005e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  39.1 
 
 
542 aa  363  6e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  40.04 
 
 
536 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  38.28 
 
 
577 aa  356  6.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  37.76 
 
 
570 aa  352  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  37.41 
 
 
560 aa  350  3e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  37.76 
 
 
558 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  38.36 
 
 
548 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.94 
 
 
529 aa  347  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  37.84 
 
 
536 aa  347  4e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  40.04 
 
 
533 aa  347  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  37.29 
 
 
568 aa  344  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  38.48 
 
 
551 aa  336  7e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  37.85 
 
 
548 aa  333  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  37.17 
 
 
530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  35.49 
 
 
523 aa  311  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.29 
 
 
531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  34.84 
 
 
552 aa  300  5e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  36.19 
 
 
527 aa  297  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  34.54 
 
 
539 aa  297  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  37.08 
 
 
526 aa  292  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  33.79 
 
 
558 aa  290  5.0000000000000004e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  36.61 
 
 
534 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  36.61 
 
 
534 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  33.53 
 
 
546 aa  278  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  31.67 
 
 
541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>