More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1577 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  100 
 
 
540 aa  1083    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  66.8 
 
 
570 aa  730    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  53.49 
 
 
545 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  53.67 
 
 
542 aa  567  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  52.56 
 
 
553 aa  568  1e-160  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  53.65 
 
 
551 aa  561  1e-158  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  51.34 
 
 
555 aa  556  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  53.14 
 
 
539 aa  552  1e-156  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  52.91 
 
 
543 aa  550  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  51.04 
 
 
554 aa  546  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  53.32 
 
 
552 aa  547  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  52.86 
 
 
551 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  50.38 
 
 
557 aa  540  9.999999999999999e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  48.98 
 
 
543 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  50.28 
 
 
553 aa  538  1e-151  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  50.54 
 
 
559 aa  534  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  49.26 
 
 
558 aa  532  1e-150  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  53.15 
 
 
551 aa  533  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  51.85 
 
 
562 aa  529  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  49.61 
 
 
559 aa  530  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  50.48 
 
 
554 aa  527  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  51.36 
 
 
542 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  51.13 
 
 
543 aa  526  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  52.76 
 
 
553 aa  527  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  49.05 
 
 
563 aa  526  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  50 
 
 
560 aa  527  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  51.17 
 
 
542 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  52.91 
 
 
552 aa  524  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  51.17 
 
 
545 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  48.87 
 
 
558 aa  523  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  49.81 
 
 
558 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  50.57 
 
 
543 aa  521  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  49.9 
 
 
548 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  48.06 
 
 
560 aa  514  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  47.5 
 
 
557 aa  511  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  49.81 
 
 
553 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  50.76 
 
 
547 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  49.9 
 
 
554 aa  501  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  49.71 
 
 
549 aa  497  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  49.52 
 
 
550 aa  494  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  49.49 
 
 
500 aa  487  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  48.84 
 
 
541 aa  477  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  48.56 
 
 
558 aa  474  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  42.66 
 
 
552 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.23 
 
 
530 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  41.98 
 
 
554 aa  444  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  42.56 
 
 
561 aa  440  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.73 
 
 
529 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  44.57 
 
 
535 aa  437  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.27 
 
 
536 aa  436  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.21 
 
 
527 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.07 
 
 
532 aa  433  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  43.11 
 
 
547 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.96 
 
 
537 aa  419  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  42.24 
 
 
548 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.31 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  39.4 
 
 
535 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.27 
 
 
519 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.09 
 
 
546 aa  377  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.12 
 
 
525 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  40.24 
 
 
527 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.92 
 
 
525 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  40.04 
 
 
528 aa  369  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  35.26 
 
 
527 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  37.98 
 
 
536 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  35.39 
 
 
538 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.73 
 
 
528 aa  360  4e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  38.4 
 
 
533 aa  359  6e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  37.83 
 
 
541 aa  358  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  37.5 
 
 
548 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  37 
 
 
550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 
567 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  34.95 
 
 
559 aa  356  6.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.6 
 
 
529 aa  353  5e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  38.51 
 
 
542 aa  350  3e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  37.38 
 
 
536 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  38.25 
 
 
548 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  38.67 
 
 
553 aa  343  5e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  37.31 
 
 
558 aa  342  9e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  35.63 
 
 
553 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  35.63 
 
 
553 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  36.02 
 
 
542 aa  339  7e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  37.45 
 
 
551 aa  333  4e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  34.77 
 
 
563 aa  330  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  34.84 
 
 
568 aa  326  5e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  33.33 
 
 
560 aa  318  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  34.22 
 
 
530 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  34.23 
 
 
577 aa  311  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  32.12 
 
 
570 aa  307  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  32.31 
 
 
531 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  31.47 
 
 
523 aa  286  7e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  34.56 
 
 
558 aa  280  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  34.39 
 
 
552 aa  278  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  33.4 
 
 
527 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  33.21 
 
 
526 aa  270  5e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  31.98 
 
 
539 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  32.7 
 
 
546 aa  247  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  28.54 
 
 
541 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  29.12 
 
 
547 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.05 
 
 
564 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>