More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0972 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  100 
 
 
532 aa  1067    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  65.65 
 
 
527 aa  687    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  63.15 
 
 
536 aa  669    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  64.96 
 
 
530 aa  689    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  61.52 
 
 
529 aa  644    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  56.18 
 
 
528 aa  568  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  52.08 
 
 
543 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  50.48 
 
 
542 aa  531  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  48.76 
 
 
551 aa  510  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  47.92 
 
 
555 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  50.37 
 
 
539 aa  507  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  48.12 
 
 
543 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  48.28 
 
 
543 aa  499  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  50.67 
 
 
552 aa  501  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  50.57 
 
 
551 aa  499  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  49.62 
 
 
551 aa  498  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  48.45 
 
 
542 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  50.48 
 
 
552 aa  495  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  48.06 
 
 
542 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  49.24 
 
 
543 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  48.26 
 
 
545 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  46.26 
 
 
560 aa  489  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  49.03 
 
 
553 aa  487  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  46.91 
 
 
570 aa  484  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  46.96 
 
 
554 aa  479  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  45.49 
 
 
557 aa  479  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  48.59 
 
 
553 aa  481  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  44.91 
 
 
559 aa  477  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  46.26 
 
 
545 aa  476  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  48.37 
 
 
547 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  44.53 
 
 
563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  45.17 
 
 
558 aa  468  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  45.75 
 
 
553 aa  465  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  47.93 
 
 
541 aa  464  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  44.94 
 
 
559 aa  457  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  46.61 
 
 
562 aa  457  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  44.7 
 
 
557 aa  456  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  46.63 
 
 
558 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  46.63 
 
 
548 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  43.3 
 
 
540 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  44.4 
 
 
552 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  47.4 
 
 
550 aa  433  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  47.05 
 
 
500 aa  433  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  46.91 
 
 
549 aa  429  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  46.72 
 
 
554 aa  431  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  41.86 
 
 
554 aa  423  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  42.26 
 
 
561 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  43.13 
 
 
547 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.8 
 
 
537 aa  421  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  43.26 
 
 
558 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  43.63 
 
 
560 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  43.6 
 
 
554 aa  413  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  41.57 
 
 
558 aa  414  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  44.02 
 
 
553 aa  405  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  41.05 
 
 
548 aa  404  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.39 
 
 
555 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.51 
 
 
546 aa  393  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.03 
 
 
525 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.97 
 
 
519 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.85 
 
 
525 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  39.42 
 
 
535 aa  367  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.5 
 
 
528 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  38.19 
 
 
538 aa  349  9e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  36.61 
 
 
527 aa  347  3e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  35.56 
 
 
567 aa  334  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  36.6 
 
 
553 aa  331  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  36.6 
 
 
553 aa  331  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  36.27 
 
 
535 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  36.1 
 
 
529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  35.66 
 
 
527 aa  327  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  36.48 
 
 
541 aa  325  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  34.77 
 
 
533 aa  313  3.9999999999999997e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  35.48 
 
 
553 aa  312  9e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  35.92 
 
 
536 aa  312  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  34.44 
 
 
536 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  34.1 
 
 
548 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  34.73 
 
 
559 aa  303  4.0000000000000003e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  34.72 
 
 
550 aa  300  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  33.02 
 
 
558 aa  298  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  34.99 
 
 
542 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  32.4 
 
 
568 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  36.52 
 
 
548 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  31.27 
 
 
570 aa  286  8e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  32.45 
 
 
542 aa  283  5.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  34.2 
 
 
551 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  32.89 
 
 
577 aa  269  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  30.5 
 
 
530 aa  262  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  30.61 
 
 
560 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  30.72 
 
 
523 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  30.34 
 
 
531 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  30.53 
 
 
527 aa  246  6.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  31.67 
 
 
539 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  30.24 
 
 
563 aa  241  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  32.52 
 
 
552 aa  240  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  29.3 
 
 
558 aa  239  8e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  30.15 
 
 
546 aa  238  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  30.74 
 
 
547 aa  229  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  30.92 
 
 
541 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  31.16 
 
 
526 aa  229  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  30.53 
 
 
534 aa  217  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>