More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01960 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  72.76 
 
 		 538 aa  811    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  60.87 
 
 		 553 aa  672    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1154    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  67.91 
 
 		 527 aa  780    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  60.87 
 
 		 553 aa  672    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  56.91 
 
 		 559 aa  655    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  39.45 
 
 		 543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  39.59 
 
 		 545 aa  395  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  38.72 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  39.48 
 
 		 553 aa  385  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  37.29 
 
 		 555 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  37.52 
 
 		 551 aa  380  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  37.55 
 
 		 543 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.72 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  39.78 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  38.78 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  36.36 
 
 		 558 aa  373  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  36.43 
 
 		 542 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  37.64 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  36.01 
 
 		 570 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  38.52 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  36.73 
 
 		 558 aa  365  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  37.64 
 
 		 560 aa  368  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  40.63 
 
 		 550 aa  365  1e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  36.56 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  40.15 
 
 		 554 aa  365  1e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  35.94 
 
 		 557 aa  364  2e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  36.18 
 
 		 543 aa  364  2e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  36.55 
 
 		 560 aa  364  2e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  40 
 
 		 549 aa  363  4e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  38.59 
 
 		 552 aa  361  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  35.48 
 
 		 543 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  36.92 
 
 		 553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  35.2 
 
 		 540 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  35.58 
 
 		 559 aa  355  1e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  35.92 
 
 		 562 aa  355  1e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  35.96 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  34.93 
 
 		 542 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  34.93 
 
 		 542 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  34.74 
 
 		 545 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  36.26 
 
 		 553 aa  346  5e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  33.89 
 
 		 563 aa  346  8e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  34.82 
 
 		 558 aa  345  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  34.08 
 
 		 559 aa  345  1e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  36.18 
 
 		 553 aa  343  4e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  37.38 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  34.88 
 
 		 554 aa  329  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  34.52 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  34.62 
 
 		 554 aa  327  3e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.56 
 
 		 532 aa  323  4e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  35.16 
 
 		 548 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  35.04 
 
 		 541 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  33.89 
 
 		 552 aa  317  5e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.7 
 
 		 527 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  34.32 
 
 		 561 aa  307  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  32.1 
 
 		 547 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.33 
 
 		 537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.88 
 
 		 530 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.4 
 
 		 529 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.01 
 
 		 536 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.85 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  34.06 
 
 		 528 aa  289  7e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  32.26 
 
 		 535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  31.73 
 
 		 550 aa  287  4e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.55 
 
 		 519 aa  283  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  31.79 
 
 		 548 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  31.93 
 
 		 541 aa  280  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  33.02 
 
 		 536 aa  277  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  30.95 
 
 		 570 aa  278  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  31.15 
 
 		 542 aa  276  6e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  30.56 
 
 		 560 aa  272  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  31.49 
 
 		 536 aa  269  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.55 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.28 
 
 		 546 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.17 
 
 		 528 aa  266  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  31.41 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  32.38 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  29.63 
 
 		 577 aa  259  8e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  31.28 
 
 		 529 aa  257  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.94 
 
 		 525 aa  256  5e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  30.42 
 
 		 558 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  28.91 
 
 		 563 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  30.44 
 
 		 553 aa  253  6e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  30.45 
 
 		 551 aa  252  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  31.27 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  29.64 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  29.56 
 
 		 542 aa  243  7e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  30.17 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  29.47 
 
 		 530 aa  229  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  26.5 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  27.29 
 
 		 558 aa  217  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  28.42 
 
 		 552 aa  217  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  30.13 
 
 		 547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  28.83 
 
 		 546 aa  213  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  27.37 
 
 		 534 aa  210  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  27.37 
 
 		 534 aa  210  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  28.01 
 
 		 581 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  28.65 
 
 		 531 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  27.49 
 
 		 527 aa  197  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  27.66 
 
 		 526 aa  193  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>