More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1258 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1258  thermosome  100 
 
 
554 aa  1098    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  60.99 
 
 
557 aa  652    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  61.06 
 
 
548 aa  639    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  85.47 
 
 
553 aa  939    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  63.85 
 
 
553 aa  674    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  61.21 
 
 
549 aa  634  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  61.25 
 
 
550 aa  628  1e-179  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  61.41 
 
 
554 aa  627  1e-178  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  56.05 
 
 
539 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  55.68 
 
 
543 aa  585  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  57.03 
 
 
545 aa  587  1e-166  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  55.47 
 
 
551 aa  580  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  53.32 
 
 
555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  54.17 
 
 
551 aa  568  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  53.69 
 
 
558 aa  565  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  55.85 
 
 
560 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  55.47 
 
 
558 aa  560  1e-158  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  55.98 
 
 
554 aa  560  1e-158  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  53.27 
 
 
559 aa  556  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  51.72 
 
 
542 aa  555  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  51.88 
 
 
570 aa  554  1e-156  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  54.34 
 
 
552 aa  553  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  54.6 
 
 
552 aa  554  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  52.75 
 
 
551 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  51.04 
 
 
540 aa  547  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  51.03 
 
 
543 aa  544  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  53.77 
 
 
553 aa  542  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  54.89 
 
 
553 aa  542  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  51.24 
 
 
543 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  52.72 
 
 
562 aa  540  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  51.64 
 
 
542 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  51.26 
 
 
545 aa  537  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  51.45 
 
 
542 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  50.29 
 
 
543 aa  526  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  51.35 
 
 
560 aa  525  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  50.1 
 
 
559 aa  519  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  49.43 
 
 
558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  50.76 
 
 
547 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  49.35 
 
 
541 aa  500  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  46.82 
 
 
557 aa  498  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  48.67 
 
 
554 aa  497  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  48.07 
 
 
563 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  48.86 
 
 
561 aa  485  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  47.83 
 
 
552 aa  478  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.96 
 
 
532 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  48.57 
 
 
500 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  46.51 
 
 
558 aa  455  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  45.44 
 
 
548 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.37 
 
 
527 aa  449  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.18 
 
 
555 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.56 
 
 
529 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  45.77 
 
 
547 aa  438  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.34 
 
 
536 aa  435  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.13 
 
 
530 aa  431  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  43.52 
 
 
535 aa  415  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.54 
 
 
537 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.91 
 
 
525 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.1 
 
 
519 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  38.88 
 
 
541 aa  390  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.41 
 
 
525 aa  385  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.6 
 
 
528 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  40.96 
 
 
528 aa  376  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  37.34 
 
 
550 aa  368  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  36.89 
 
 
538 aa  360  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  38.45 
 
 
536 aa  358  9.999999999999999e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.4 
 
 
570 aa  358  9.999999999999999e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  39.14 
 
 
548 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.41 
 
 
546 aa  353  5e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  38.16 
 
 
553 aa  352  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  38.16 
 
 
553 aa  352  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  36.92 
 
 
548 aa  350  4e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  38.55 
 
 
535 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  39.13 
 
 
527 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  37.48 
 
 
542 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  38.01 
 
 
558 aa  346  6e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  37.31 
 
 
553 aa  343  2.9999999999999997e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  36.75 
 
 
568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.09 
 
 
529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  36.28 
 
 
542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  35.39 
 
 
559 aa  335  2e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  37.65 
 
 
533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  35.24 
 
 
577 aa  328  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 
567 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  36.91 
 
 
536 aa  326  8.000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  37.03 
 
 
551 aa  325  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  33.78 
 
 
527 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.84 
 
 
560 aa  320  3e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  34.49 
 
 
530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  36.13 
 
 
531 aa  298  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  32.83 
 
 
563 aa  296  9e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  34.91 
 
 
558 aa  294  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  35.63 
 
 
552 aa  286  8e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  35.8 
 
 
539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  34.97 
 
 
527 aa  282  9e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.92 
 
 
523 aa  280  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  33.97 
 
 
546 aa  280  4e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  34.05 
 
 
526 aa  261  2e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  34.23 
 
 
534 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  34.23 
 
 
534 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  30.94 
 
 
541 aa  248  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>