More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0271 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  68.12 
 
 		 536 aa  736    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  100 
 
 		 529 aa  1058    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  62.96 
 
 		 528 aa  640    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  61.52 
 
 		 532 aa  644    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  69.64 
 
 		 530 aa  745    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  69.77 
 
 		 527 aa  737    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  54.23 
 
 		 542 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  52.69 
 
 		 555 aa  557  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  53.82 
 
 		 543 aa  552  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  51.23 
 
 		 543 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  53.36 
 
 		 539 aa  536  1e-151  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  54.81 
 
 		 551 aa  525  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  51.43 
 
 		 551 aa  526  1e-148  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  53.65 
 
 		 552 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  52.58 
 
 		 553 aa  513  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  52.31 
 
 		 551 aa  514  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  51.25 
 
 		 553 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  51.17 
 
 		 543 aa  502  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  50.39 
 
 		 545 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  50.19 
 
 		 542 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  52.5 
 
 		 552 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  50.39 
 
 		 542 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  47.88 
 
 		 560 aa  501  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  50.19 
 
 		 558 aa  492  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  48.27 
 
 		 557 aa  492  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  50.68 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  48.46 
 
 		 559 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  50.96 
 
 		 547 aa  482  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  47.5 
 
 		 563 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  51.26 
 
 		 500 aa  477  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  47.78 
 
 		 545 aa  476  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  49.33 
 
 		 541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  44.51 
 
 		 554 aa  464  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  49.62 
 
 		 558 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  45.47 
 
 		 570 aa  465  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  46.37 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  45.95 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  45.11 
 
 		 547 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  45.66 
 
 		 561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  45.56 
 
 		 554 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.77 
 
 		 537 aa  443  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  43.71 
 
 		 540 aa  443  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  45 
 
 		 553 aa  440  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  43.81 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  45.02 
 
 		 548 aa  429  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.69 
 
 		 555 aa  429  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  44.89 
 
 		 548 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  43.21 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  44.51 
 
 		 558 aa  418  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  44.4 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  45.59 
 
 		 550 aa  414  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  44.21 
 
 		 560 aa  412  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  44.64 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  44.64 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  44.21 
 
 		 553 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.64 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  40.8 
 
 		 558 aa  398  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.43 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.85 
 
 		 525 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.1 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.49 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  38.45 
 
 		 535 aa  347  4e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.57 
 
 		 529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  35.48 
 
 		 538 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  36.36 
 
 		 550 aa  335  1e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  37.1 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  37.33 
 
 		 535 aa  334  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  37.48 
 
 		 527 aa  333  5e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  35.4 
 
 		 548 aa  333  7.000000000000001e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  34.49 
 
 		 527 aa  326  7e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  37.34 
 
 		 536 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  36.57 
 
 		 548 aa  317  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  37.09 
 
 		 542 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  34.04 
 
 		 553 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  34.04 
 
 		 553 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  34.48 
 
 		 559 aa  309  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  32.4 
 
 		 567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  34.22 
 
 		 536 aa  302  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  34.48 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  32.96 
 
 		 568 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  34.48 
 
 		 553 aa  300  6e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  35.63 
 
 		 542 aa  298  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  32.75 
 
 		 533 aa  296  5e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  33.9 
 
 		 570 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  33.58 
 
 		 560 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  33.21 
 
 		 577 aa  285  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  34.27 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  32.82 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  32.76 
 
 		 530 aa  269  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  30.64 
 
 		 523 aa  260  4e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  31.67 
 
 		 563 aa  253  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  32.65 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.11 
 
 		 564 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  31.41 
 
 		 539 aa  240  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  31.02 
 
 		 526 aa  240  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  32.55 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  29.3 
 
 		 558 aa  228  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  30.16 
 
 		 547 aa  226  9e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  32.18 
 
 		 534 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  32.18 
 
 		 534 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>