More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0416 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3025  thermosome  76.6 
 
 		 561 aa  790    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  74.24 
 
 		 552 aa  764    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  100 
 
 		 548 aa  1078    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  66.09 
 
 		 555 aa  677    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  75.66 
 
 		 554 aa  799    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  58.67 
 
 		 558 aa  580  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  57.17 
 
 		 559 aa  568  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  56.84 
 
 		 563 aa  546  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  54.61 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  52.59 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  51.92 
 
 		 542 aa  522  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  52.88 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  52.37 
 
 		 543 aa  520  1e-146  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  52.02 
 
 		 551 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  48.43 
 
 		 543 aa  509  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  49.42 
 
 		 555 aa  509  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  52.59 
 
 		 552 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  53.63 
 
 		 553 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  50.48 
 
 		 542 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  50.1 
 
 		 545 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  50.29 
 
 		 542 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  51.92 
 
 		 552 aa  505  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  49.91 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  48.88 
 
 		 539 aa  499  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  48.09 
 
 		 551 aa  496  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  55.13 
 
 		 558 aa  484  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  48.56 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  46.56 
 
 		 545 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  46.35 
 
 		 560 aa  462  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  44.9 
 
 		 554 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  47.33 
 
 		 547 aa  462  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  47.15 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  44.1 
 
 		 570 aa  450  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.44 
 
 		 546 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  44 
 
 		 557 aa  441  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  43.56 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.51 
 
 		 530 aa  433  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.89 
 
 		 529 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  41.76 
 
 		 553 aa  430  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  42.48 
 
 		 540 aa  429  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  44.91 
 
 		 548 aa  421  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.15 
 
 		 519 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.22 
 
 		 536 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  42.78 
 
 		 562 aa  410  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.77 
 
 		 527 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.4 
 
 		 525 aa  409  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  45.61 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  44.25 
 
 		 541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.15 
 
 		 525 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  45.49 
 
 		 550 aa  404  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.97 
 
 		 532 aa  403  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  44.72 
 
 		 554 aa  401  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  42.07 
 
 		 558 aa  398  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  42.23 
 
 		 554 aa  395  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.57 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  41.41 
 
 		 560 aa  397  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  39.41 
 
 		 558 aa  393  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.67 
 
 		 537 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  41.73 
 
 		 547 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  41.6 
 
 		 553 aa  388  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  39.12 
 
 		 528 aa  362  8e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  35.06 
 
 		 538 aa  340  5e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  36.75 
 
 		 535 aa  332  8e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  35.16 
 
 		 567 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  32.38 
 
 		 527 aa  311  2.9999999999999997e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  35.36 
 
 		 553 aa  310  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  35.81 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  34.99 
 
 		 542 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  34.69 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  33.51 
 
 		 559 aa  300  7e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  36.45 
 
 		 535 aa  298  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  33.27 
 
 		 568 aa  297  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  33.9 
 
 		 570 aa  291  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  34.59 
 
 		 550 aa  290  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  34.71 
 
 		 527 aa  288  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  32.25 
 
 		 553 aa  286  5.999999999999999e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  32.25 
 
 		 553 aa  286  5.999999999999999e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  32.65 
 
 		 548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  34.45 
 
 		 551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  33.58 
 
 		 536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  34.36 
 
 		 529 aa  278  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  34.07 
 
 		 577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  33.84 
 
 		 542 aa  275  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  33.02 
 
 		 548 aa  269  8.999999999999999e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  33.72 
 
 		 536 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  34.96 
 
 		 533 aa  268  1e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.09 
 
 		 531 aa  266  5.999999999999999e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  33.21 
 
 		 563 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  33.6 
 
 		 560 aa  265  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  32.5 
 
 		 530 aa  264  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  32.45 
 
 		 523 aa  258  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  33.33 
 
 		 552 aa  253  5.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  31 
 
 		 558 aa  249  8e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  31.32 
 
 		 539 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  32.04 
 
 		 527 aa  240  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  31.63 
 
 		 546 aa  237  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  30.71 
 
 		 549 aa  237  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  32.81 
 
 		 534 aa  236  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  32.81 
 
 		 534 aa  236  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  33.02 
 
 		 526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>