More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03610 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  100 
 
 		 547 aa  1102    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  55.4 
 
 		 581 aa  620  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  52.89 
 
 		 549 aa  578  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  50.87 
 
 		 541 aa  531  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40956  predicted protein  44.08 
 
 		 529 aa  405  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  35.42 
 
 		 558 aa  298  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  33.21 
 
 		 543 aa  288  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  32.58 
 
 		 539 aa  283  8.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  32.46 
 
 		 542 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  32.64 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  31.19 
 
 		 555 aa  277  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  34.27 
 
 		 554 aa  276  8e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  33.77 
 
 		 558 aa  276  8e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  31.47 
 
 		 551 aa  274  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  30.78 
 
 		 551 aa  273  6e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  32.22 
 
 		 563 aa  273  7e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  30.86 
 
 		 545 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  33.02 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  30.87 
 
 		 542 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  33.02 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  31.58 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  32.36 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  33.84 
 
 		 560 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.28 
 
 		 551 aa  269  8e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  30.68 
 
 		 542 aa  269  8e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  30.68 
 
 		 543 aa  269  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  33.77 
 
 		 562 aa  266  8e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  34.16 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  32.6 
 
 		 559 aa  263  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  32.68 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  32.9 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  32.09 
 
 		 553 aa  259  6e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  31.38 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  32.87 
 
 		 561 aa  254  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  30.51 
 
 		 552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  30.32 
 
 		 543 aa  253  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  31.36 
 
 		 560 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  29.41 
 
 		 570 aa  247  3e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  29.47 
 
 		 540 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  32.69 
 
 		 558 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  31.73 
 
 		 536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  30.82 
 
 		 558 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  31.96 
 
 		 552 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.05 
 
 		 555 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  30 
 
 		 500 aa  243  5e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.15 
 
 		 530 aa  243  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.54 
 
 		 536 aa  242  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  31.65 
 
 		 554 aa  240  4e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  30 
 
 		 547 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.8 
 
 		 537 aa  239  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  30.48 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  30.48 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  29.36 
 
 		 557 aa  236  8e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  31.25 
 
 		 547 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  29.44 
 
 		 533 aa  233  6e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  30.86 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  31.77 
 
 		 548 aa  227  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  30.36 
 
 		 553 aa  227  5.0000000000000005e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.27 
 
 		 529 aa  226  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.58 
 
 		 532 aa  226  6e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  31.81 
 
 		 550 aa  226  7e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  30.11 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  31.5 
 
 		 549 aa  224  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  30.2 
 
 		 527 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  30.41 
 
 		 535 aa  223  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  27.65 
 
 		 528 aa  223  9e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  30.86 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  28.77 
 
 		 536 aa  219  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  30.33 
 
 		 567 aa  218  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  29.36 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  29.31 
 
 		 563 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  29.42 
 
 		 538 aa  216  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  27.83 
 
 		 560 aa  216  9e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  29.45 
 
 		 550 aa  216  9e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  30.04 
 
 		 529 aa  215  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  28.82 
 
 		 541 aa  213  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.11 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  28.52 
 
 		 527 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.75 
 
 		 525 aa  211  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.75 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  28.95 
 
 		 542 aa  210  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  29.3 
 
 		 542 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  28.52 
 
 		 559 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.59 
 
 		 525 aa  204  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  28.31 
 
 		 553 aa  204  5e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.6 
 
 		 527 aa  200  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  27.11 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  29.06 
 
 		 577 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.76 
 
 		 528 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  29.84 
 
 		 548 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  29.17 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  29.52 
 
 		 558 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  27.45 
 
 		 568 aa  190  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  28.88 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  29.08 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  27.74 
 
 		 523 aa  177  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  30.02 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  26.2 
 
 		 558 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  24.29 
 
 		 539 aa  157  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  27.54 
 
 		 527 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>