More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA02700 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  68.45 
 
 		 563 aa  771    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  57.09 
 
 		 577 aa  638    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  100 
 
 		 560 aa  1145    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  63.23 
 
 		 570 aa  691    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  70.04 
 
 		 542 aa  767    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  36.84 
 
 		 555 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  37.88 
 
 		 545 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  35.94 
 
 		 570 aa  345  1e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  34.94 
 
 		 551 aa  342  1e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  35.27 
 
 		 543 aa  342  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  36.99 
 
 		 543 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  36.04 
 
 		 542 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  37.55 
 
 		 547 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  36.83 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  37.17 
 
 		 551 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  36.6 
 
 		 539 aa  332  9e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  36.59 
 
 		 553 aa  332  1e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  37.69 
 
 		 563 aa  330  6e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  34.77 
 
 		 554 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  36.19 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  34.02 
 
 		 558 aa  326  6e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.79 
 
 		 551 aa  323  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  34.4 
 
 		 560 aa  323  4e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  37.38 
 
 		 552 aa  323  5e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  36.28 
 
 		 553 aa  323  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  36.15 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  34.84 
 
 		 554 aa  320  5e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  35.8 
 
 		 545 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  33.02 
 
 		 558 aa  319  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  35.67 
 
 		 543 aa  318  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  35.12 
 
 		 560 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  35.4 
 
 		 542 aa  317  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  33.21 
 
 		 540 aa  317  5e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  35.8 
 
 		 542 aa  316  6e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  34.46 
 
 		 541 aa  316  6e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  37.07 
 
 		 552 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  35.45 
 
 		 543 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  36.36 
 
 		 542 aa  310  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  34.46 
 
 		 553 aa  310  4e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  33.33 
 
 		 559 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  34.62 
 
 		 559 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  34.29 
 
 		 558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  34.35 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  31.65 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  35.77 
 
 		 558 aa  300  5e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  34.54 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  31.91 
 
 		 538 aa  293  8e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  33.96 
 
 		 553 aa  293  8e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  36.61 
 
 		 530 aa  292  9e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  34.54 
 
 		 554 aa  292  9e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  36.06 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.09 
 
 		 537 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  34.29 
 
 		 550 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  32.65 
 
 		 562 aa  288  1e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  32.44 
 
 		 559 aa  289  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  33.21 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  34.47 
 
 		 552 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  30.26 
 
 		 547 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  32.33 
 
 		 558 aa  281  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.58 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  32.22 
 
 		 568 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  35.79 
 
 		 526 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.27 
 
 		 530 aa  276  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  32.93 
 
 		 500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.27 
 
 		 546 aa  272  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  30.55 
 
 		 567 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  31.2 
 
 		 553 aa  270  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  31.2 
 
 		 553 aa  270  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  34.25 
 
 		 523 aa  269  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  33.02 
 
 		 561 aa  269  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  35.42 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.76 
 
 		 525 aa  266  7e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.26 
 
 		 555 aa  266  7e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  33.14 
 
 		 535 aa  266  8e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.7 
 
 		 525 aa  264  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.12 
 
 		 519 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.87 
 
 		 527 aa  260  6e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.11 
 
 		 536 aa  259  6e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  31.02 
 
 		 550 aa  256  6e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  33.8 
 
 		 548 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.61 
 
 		 532 aa  252  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  32 
 
 		 528 aa  252  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  32.45 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  32.24 
 
 		 535 aa  251  4e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  31.93 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  34.11 
 
 		 527 aa  242  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  30.02 
 
 		 536 aa  240  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  29.24 
 
 		 548 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  30.98 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  29.92 
 
 		 548 aa  230  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  31.17 
 
 		 529 aa  230  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  28.82 
 
 		 541 aa  227  5.0000000000000005e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  27 
 
 		 536 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  28.63 
 
 		 541 aa  213  9e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  27.96 
 
 		 552 aa  207  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  27.83 
 
 		 547 aa  207  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  29.36 
 
 		 546 aa  204  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  28.29 
 
 		 581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  26.34 
 
 		 558 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.29 
 
 		 564 aa  195  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>