More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0733 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  100 
 
 
541 aa  1073    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  57.95 
 
 
542 aa  587  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  57.44 
 
 
543 aa  581  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  54.49 
 
 
555 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  56.13 
 
 
552 aa  550  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  55.26 
 
 
551 aa  546  1e-154  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  54.38 
 
 
551 aa  545  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  54.27 
 
 
553 aa  546  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  55.23 
 
 
542 aa  544  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  55.04 
 
 
545 aa  544  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  55.62 
 
 
543 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  54.84 
 
 
542 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  55.73 
 
 
552 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  52.14 
 
 
543 aa  534  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  53.92 
 
 
543 aa  532  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  54.17 
 
 
539 aa  530  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  53.64 
 
 
551 aa  530  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  53.6 
 
 
553 aa  530  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  50.58 
 
 
570 aa  520  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  51.06 
 
 
558 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  51.25 
 
 
559 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  51.06 
 
 
563 aa  514  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  49.72 
 
 
554 aa  512  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  50.29 
 
 
557 aa  513  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  50 
 
 
560 aa  509  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  52.87 
 
 
547 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  48.28 
 
 
553 aa  498  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  50.67 
 
 
545 aa  495  1e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  48.02 
 
 
557 aa  489  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  49.13 
 
 
540 aa  491  1e-137  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.96 
 
 
530 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.84 
 
 
536 aa  484  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  49.45 
 
 
562 aa  483  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  50.1 
 
 
558 aa  481  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  48.86 
 
 
559 aa  473  1e-132  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.33 
 
 
529 aa  474  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  48.76 
 
 
552 aa  473  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  49.24 
 
 
548 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.93 
 
 
532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.28 
 
 
527 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  51.15 
 
 
500 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  47.73 
 
 
558 aa  468  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  49.81 
 
 
549 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  50.76 
 
 
558 aa  461  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  50.38 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  49.81 
 
 
554 aa  460  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  50.57 
 
 
554 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  46.17 
 
 
547 aa  455  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  44.83 
 
 
554 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  49.62 
 
 
550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.77 
 
 
537 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  49.24 
 
 
553 aa  444  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  45.21 
 
 
561 aa  433  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.87 
 
 
555 aa  423  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  44.25 
 
 
548 aa  413  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  42.97 
 
 
528 aa  412  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.27 
 
 
528 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.89 
 
 
519 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.98 
 
 
525 aa  401  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.63 
 
 
525 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.69 
 
 
546 aa  382  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  39.92 
 
 
535 aa  378  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  37.97 
 
 
538 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  37.48 
 
 
527 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  40.27 
 
 
535 aa  363  4e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  38.58 
 
 
542 aa  360  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  40.11 
 
 
541 aa  360  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  38.19 
 
 
550 aa  355  1e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  39.31 
 
 
536 aa  352  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  36.66 
 
 
553 aa  338  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  36.66 
 
 
553 aa  338  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  35.15 
 
 
559 aa  337  2.9999999999999997e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  35.04 
 
 
567 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  36.62 
 
 
548 aa  336  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  38.24 
 
 
527 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  37.67 
 
 
563 aa  331  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  38.59 
 
 
548 aa  330  3e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  37.7 
 
 
553 aa  330  3e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.17 
 
 
570 aa  330  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  37.67 
 
 
536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.76 
 
 
529 aa  328  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  38.27 
 
 
542 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  37.33 
 
 
533 aa  327  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  37.59 
 
 
551 aa  327  4.0000000000000003e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.46 
 
 
560 aa  326  5e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  37.71 
 
 
577 aa  325  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  36.9 
 
 
558 aa  319  7.999999999999999e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  36.06 
 
 
568 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  34.23 
 
 
530 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.97 
 
 
523 aa  280  5e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  33.52 
 
 
531 aa  278  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  32.71 
 
 
547 aa  269  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  32.77 
 
 
552 aa  264  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  31.49 
 
 
541 aa  263  6.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  33.27 
 
 
526 aa  262  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  32.95 
 
 
558 aa  261  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  31.99 
 
 
539 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  33.66 
 
 
527 aa  257  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  30.97 
 
 
581 aa  253  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.14 
 
 
564 aa  248  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>