More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3171 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  100 
 
 		 547 aa  1095    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  53.75 
 
 		 537 aa  585  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  49.52 
 
 		 542 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  49.35 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  47.98 
 
 		 555 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  49.9 
 
 		 543 aa  495  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  49.5 
 
 		 542 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  49.5 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  49.7 
 
 		 545 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  45.74 
 
 		 563 aa  485  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  47 
 
 		 543 aa  485  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  46.81 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  49.01 
 
 		 543 aa  477  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  48.85 
 
 		 552 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  47.05 
 
 		 551 aa  474  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  49.23 
 
 		 551 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  46.71 
 
 		 558 aa  466  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  47.31 
 
 		 539 aa  463  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  44.96 
 
 		 559 aa  463  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  45.19 
 
 		 560 aa  462  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  46.63 
 
 		 551 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  47.69 
 
 		 552 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  47.99 
 
 		 553 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  47.31 
 
 		 547 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  45.3 
 
 		 553 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.11 
 
 		 529 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  46.17 
 
 		 541 aa  442  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.62 
 
 		 530 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.91 
 
 		 536 aa  442  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  45.77 
 
 		 554 aa  438  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  44.08 
 
 		 570 aa  437  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  42.5 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  46.23 
 
 		 558 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  44.95 
 
 		 500 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  42.94 
 
 		 557 aa  427  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  43.11 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.31 
 
 		 527 aa  422  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  42.61 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  43.19 
 
 		 548 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  41.38 
 
 		 554 aa  409  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.13 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  41.6 
 
 		 545 aa  409  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  43.59 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  43.76 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  43.38 
 
 		 554 aa  404  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.57 
 
 		 555 aa  395  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  40.77 
 
 		 561 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  43.3 
 
 		 528 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  39.66 
 
 		 559 aa  381  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  41.73 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  40.66 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  40.12 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  40.12 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.42 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.42 
 
 		 525 aa  364  2e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  36.93 
 
 		 558 aa  363  4e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  39.66 
 
 		 562 aa  362  7.0000000000000005e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.08 
 
 		 528 aa  362  8e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.42 
 
 		 525 aa  359  8e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  40.12 
 
 		 553 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.83 
 
 		 546 aa  353  5e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  36.47 
 
 		 535 aa  330  4e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  37.25 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  34.66 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  37.4 
 
 		 550 aa  317  4e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  33.21 
 
 		 538 aa  316  8e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  34.3 
 
 		 536 aa  313  6.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  35.04 
 
 		 527 aa  313  7.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  35.06 
 
 		 548 aa  312  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  35.43 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  32.1 
 
 		 567 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  33.27 
 
 		 559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  34.23 
 
 		 553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  34.23 
 
 		 553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  35.31 
 
 		 542 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  35.67 
 
 		 548 aa  300  4e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  35.38 
 
 		 551 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  34.05 
 
 		 533 aa  297  3e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  32.26 
 
 		 570 aa  297  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  33.2 
 
 		 529 aa  296  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  31.29 
 
 		 527 aa  292  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  32.91 
 
 		 577 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  33.33 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  31.59 
 
 		 568 aa  286  9e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  33.4 
 
 		 558 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  32.88 
 
 		 542 aa  286  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  31.81 
 
 		 563 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  30.26 
 
 		 560 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  31.65 
 
 		 558 aa  269  8.999999999999999e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  32.05 
 
 		 552 aa  264  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  32.55 
 
 		 530 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  31.06 
 
 		 539 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  30.9 
 
 		 546 aa  246  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  30.84 
 
 		 523 aa  243  5e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  31.12 
 
 		 531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  29.25 
 
 		 547 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  28.95 
 
 		 541 aa  229  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  32.01 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  30.57 
 
 		 527 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.28 
 
 		 564 aa  217  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>