More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01290 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  66.6 
 
 
536 aa  737    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  100 
 
 
535 aa  1081    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  66.73 
 
 
533 aa  711    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  61.15 
 
 
527 aa  637    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  60 
 
 
529 aa  623  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  42.13 
 
 
542 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  39.4 
 
 
540 aa  392  1e-107  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  41.73 
 
 
555 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  41.88 
 
 
570 aa  389  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  42.65 
 
 
539 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  40.35 
 
 
543 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  41.93 
 
 
543 aa  375  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  41.5 
 
 
545 aa  378  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  41.04 
 
 
551 aa  372  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  40.86 
 
 
551 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  41.04 
 
 
553 aa  368  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  41.49 
 
 
552 aa  364  3e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  39.68 
 
 
557 aa  362  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  40.23 
 
 
559 aa  359  8e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  41.88 
 
 
547 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  39 
 
 
558 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.84 
 
 
551 aa  355  1e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  38.37 
 
 
557 aa  353  5e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  39.8 
 
 
545 aa  352  7e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  40 
 
 
542 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  40 
 
 
542 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  40.86 
 
 
552 aa  350  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  38.68 
 
 
563 aa  350  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  39.28 
 
 
558 aa  350  4e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  38.55 
 
 
554 aa  348  1e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  39.38 
 
 
562 aa  346  5e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  37.98 
 
 
543 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  40.27 
 
 
541 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  39.6 
 
 
543 aa  345  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  39.8 
 
 
553 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  37.68 
 
 
500 aa  344  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  37.83 
 
 
553 aa  343  2.9999999999999997e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  38.65 
 
 
560 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  40.84 
 
 
548 aa  343  4e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  40.71 
 
 
554 aa  343  5.999999999999999e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  39.92 
 
 
558 aa  342  1e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  40.91 
 
 
560 aa  342  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  37.68 
 
 
559 aa  339  7e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  41.63 
 
 
550 aa  337  5e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  39.88 
 
 
558 aa  333  4e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  37.33 
 
 
536 aa  331  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  40.84 
 
 
549 aa  331  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  36.47 
 
 
547 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  41.11 
 
 
553 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  37.21 
 
 
530 aa  329  7e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  40.64 
 
 
554 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  35.84 
 
 
541 aa  323  5e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  37.65 
 
 
552 aa  322  9.000000000000001e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  37.33 
 
 
529 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  36.59 
 
 
535 aa  318  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.43 
 
 
527 aa  317  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.27 
 
 
532 aa  317  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.39 
 
 
537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  35.09 
 
 
536 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  35.59 
 
 
550 aa  300  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  34.86 
 
 
554 aa  294  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  36.45 
 
 
548 aa  292  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  35.45 
 
 
548 aa  291  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.15 
 
 
555 aa  290  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  33.4 
 
 
548 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  36.2 
 
 
561 aa  290  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  36.42 
 
 
551 aa  289  9e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  33.2 
 
 
538 aa  288  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  35.98 
 
 
542 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  32.93 
 
 
553 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  32.93 
 
 
553 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.46 
 
 
546 aa  283  6.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  35.63 
 
 
530 aa  281  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  34.56 
 
 
542 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  30.57 
 
 
527 aa  276  8e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  35.25 
 
 
523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  34.93 
 
 
570 aa  274  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.06 
 
 
525 aa  270  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.39 
 
 
528 aa  268  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  35.15 
 
 
531 aa  267  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  33.98 
 
 
577 aa  266  8.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  32.38 
 
 
567 aa  265  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  32.14 
 
 
568 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  33.46 
 
 
553 aa  260  4e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  35.15 
 
 
526 aa  259  6e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  34.29 
 
 
558 aa  258  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  31.59 
 
 
559 aa  253  4.0000000000000004e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.53 
 
 
525 aa  253  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  32.24 
 
 
560 aa  250  4e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.25 
 
 
519 aa  250  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  34.48 
 
 
527 aa  247  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  31.37 
 
 
528 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  32.36 
 
 
563 aa  243  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  30.98 
 
 
581 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  27.38 
 
 
541 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  29.85 
 
 
547 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.54 
 
 
564 aa  210  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  28.91 
 
 
558 aa  204  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  27.12 
 
 
549 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  29.22 
 
 
552 aa  190  5e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>