More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1771 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  100 
 
 		 554 aa  1088    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  95.27 
 
 		 553 aa  947    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  66.8 
 
 		 545 aa  683    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  96.03 
 
 		 560 aa  981    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  95.83 
 
 		 558 aa  983    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  73.83 
 
 		 558 aa  822    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  60.8 
 
 		 559 aa  632  1e-180  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  59.26 
 
 		 562 aa  614  9.999999999999999e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  58.71 
 
 		 553 aa  592  1e-168  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  56.77 
 
 		 557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  55.66 
 
 		 554 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  57.31 
 
 		 548 aa  571  1e-161  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  54.73 
 
 		 539 aa  569  1e-161  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  55.38 
 
 		 553 aa  565  1e-160  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  53.03 
 
 		 570 aa  559  1e-158  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  53.65 
 
 		 543 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  58.27 
 
 		 550 aa  556  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  57.58 
 
 		 549 aa  553  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  57.31 
 
 		 554 aa  554  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  53.67 
 
 		 551 aa  542  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  50.57 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  51.72 
 
 		 555 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  51.24 
 
 		 542 aa  536  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  52.18 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  50.29 
 
 		 543 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  51.64 
 
 		 551 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  50.47 
 
 		 543 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  50.87 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  51.99 
 
 		 552 aa  504  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  49.52 
 
 		 560 aa  503  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  47.82 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  50.1 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  50.29 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  47.04 
 
 		 559 aa  489  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  51.92 
 
 		 552 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  49.9 
 
 		 545 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  51.34 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  48 
 
 		 558 aa  488  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  49.71 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  46.91 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  48.77 
 
 		 547 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  50.65 
 
 		 541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  47.05 
 
 		 558 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  45.21 
 
 		 552 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  43.29 
 
 		 554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  47.43 
 
 		 500 aa  444  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  43.17 
 
 		 561 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.17 
 
 		 530 aa  438  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.91 
 
 		 527 aa  420  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.67 
 
 		 536 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.75 
 
 		 532 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.4 
 
 		 529 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.6 
 
 		 555 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  39.81 
 
 		 538 aa  402  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  42.37 
 
 		 548 aa  403  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.27 
 
 		 537 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  40.6 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  40.6 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  40.38 
 
 		 547 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.56 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  42.17 
 
 		 541 aa  389  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  41.01 
 
 		 548 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.54 
 
 		 528 aa  385  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.6 
 
 		 519 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  38.2 
 
 		 527 aa  384  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  40.53 
 
 		 550 aa  381  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.97 
 
 		 546 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.43 
 
 		 525 aa  372  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  37.34 
 
 		 559 aa  372  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  40.19 
 
 		 536 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  41.68 
 
 		 548 aa  369  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  40.92 
 
 		 542 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  39.32 
 
 		 528 aa  365  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  36.01 
 
 		 567 aa  363  4e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  40.7 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  37.55 
 
 		 558 aa  360  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  40.71 
 
 		 535 aa  358  9.999999999999999e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  38.9 
 
 		 536 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  39.37 
 
 		 527 aa  351  2e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  39.96 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  36.33 
 
 		 570 aa  347  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  35.64 
 
 		 568 aa  347  4e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  36.93 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.77 
 
 		 560 aa  340  4e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  34.33 
 
 		 542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  37.27 
 
 		 551 aa  337  2.9999999999999997e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  36.71 
 
 		 577 aa  328  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  34.67 
 
 		 563 aa  318  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  34.9 
 
 		 552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  35.23 
 
 		 530 aa  312  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  35.24 
 
 		 558 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  35.85 
 
 		 531 aa  310  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  35.27 
 
 		 523 aa  300  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  32.69 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  34.73 
 
 		 539 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  36.12 
 
 		 527 aa  296  8e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  35.99 
 
 		 534 aa  286  5e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  35.99 
 
 		 534 aa  286  5e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  33.4 
 
 		 547 aa  281  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  32.49 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>