More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2095 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1270  thermosome  77.88 
 
 
559 aa  810    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  100 
 
 
557 aa  1080    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  74.62 
 
 
558 aa  769    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  58.55 
 
 
543 aa  637    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  92.65 
 
 
558 aa  888    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  79.42 
 
 
563 aa  806    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  58.16 
 
 
542 aa  626  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  58.89 
 
 
551 aa  621  1e-176  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  59.73 
 
 
551 aa  615  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  57.12 
 
 
555 aa  617  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  58.45 
 
 
545 aa  611  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  59.08 
 
 
552 aa  608  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  58.64 
 
 
543 aa  610  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  58.45 
 
 
542 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  58.64 
 
 
542 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  60.19 
 
 
553 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  59.04 
 
 
552 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  54.22 
 
 
543 aa  595  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  56.23 
 
 
543 aa  593  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  54.02 
 
 
551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  57.84 
 
 
552 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  54.32 
 
 
539 aa  561  1.0000000000000001e-159  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  54.04 
 
 
547 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  54.44 
 
 
554 aa  560  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  57.06 
 
 
561 aa  559  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  54.46 
 
 
548 aa  523  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  49.33 
 
 
570 aa  519  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  48.94 
 
 
560 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  49.52 
 
 
553 aa  518  1e-146  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  52.33 
 
 
500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  49.24 
 
 
545 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  52.5 
 
 
546 aa  514  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  48.08 
 
 
540 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  52.88 
 
 
555 aa  508  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  47.29 
 
 
557 aa  502  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  46.82 
 
 
554 aa  497  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  50.29 
 
 
541 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  52.39 
 
 
525 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  46.72 
 
 
553 aa  487  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.62 
 
 
519 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  46.63 
 
 
547 aa  479  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.4 
 
 
530 aa  480  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.27 
 
 
529 aa  481  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  47.23 
 
 
548 aa  476  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.44 
 
 
527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.26 
 
 
536 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  46.78 
 
 
558 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  45.11 
 
 
559 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.49 
 
 
532 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  46.31 
 
 
560 aa  466  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.93 
 
 
525 aa  468  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  47.16 
 
 
549 aa  462  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.05 
 
 
528 aa  462  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  46.6 
 
 
554 aa  461  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  47.43 
 
 
554 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  46.69 
 
 
553 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  47.05 
 
 
550 aa  458  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  44.3 
 
 
562 aa  449  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  42.53 
 
 
558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.39 
 
 
537 aa  433  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  42.08 
 
 
528 aa  403  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  37.69 
 
 
538 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  40 
 
 
535 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  36.1 
 
 
527 aa  382  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  38 
 
 
553 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  38 
 
 
553 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  36.65 
 
 
559 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  35.94 
 
 
567 aa  365  2e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  39.68 
 
 
535 aa  362  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  39.77 
 
 
542 aa  357  5e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  38.46 
 
 
550 aa  354  2e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  37.38 
 
 
541 aa  346  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  37.14 
 
 
536 aa  342  9e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  36.05 
 
 
529 aa  342  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  38.78 
 
 
553 aa  340  2.9999999999999998e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  36.61 
 
 
527 aa  340  4e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  36.95 
 
 
563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  37.14 
 
 
548 aa  336  5e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  37.2 
 
 
558 aa  336  5.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.18 
 
 
570 aa  333  5e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  38.04 
 
 
548 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  36.03 
 
 
542 aa  327  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  35.25 
 
 
536 aa  326  6e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  35.37 
 
 
533 aa  326  6e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  35.51 
 
 
577 aa  326  6e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  35.88 
 
 
568 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  36.15 
 
 
560 aa  321  3e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  36.53 
 
 
551 aa  314  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  33.65 
 
 
541 aa  287  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.66 
 
 
564 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  33.9 
 
 
530 aa  279  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.1 
 
 
531 aa  278  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  34.46 
 
 
552 aa  277  4e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  36.06 
 
 
534 aa  277  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  36.06 
 
 
534 aa  277  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  33.45 
 
 
539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  33.15 
 
 
546 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  32.64 
 
 
558 aa  271  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.85 
 
 
523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  32.56 
 
 
547 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>