More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0761 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  63.13 
 
 
551 aa  638    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  98.89 
 
 
542 aa  1064    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  78.82 
 
 
543 aa  839    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  62.62 
 
 
551 aa  638    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  97.89 
 
 
545 aa  1012    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  94.07 
 
 
543 aa  981    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  61.73 
 
 
542 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  61.39 
 
 
543 aa  642    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  100 
 
 
542 aa  1075    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  60.23 
 
 
555 aa  633  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  62.74 
 
 
552 aa  634  1e-180  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  62.84 
 
 
552 aa  626  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  60.76 
 
 
553 aa  619  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  60.35 
 
 
551 aa  610  1e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  58.64 
 
 
557 aa  608  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  57.56 
 
 
558 aa  605  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  56.57 
 
 
543 aa  601  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  60.04 
 
 
539 aa  600  1e-170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  56.48 
 
 
559 aa  596  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  57.62 
 
 
563 aa  593  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  58.82 
 
 
558 aa  571  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  57.59 
 
 
547 aa  565  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  54.35 
 
 
570 aa  558  1e-158  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  54.56 
 
 
553 aa  552  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  53.2 
 
 
560 aa  549  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  53.46 
 
 
552 aa  544  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  55 
 
 
500 aa  543  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  51.05 
 
 
554 aa  536  1e-151  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  51.35 
 
 
557 aa  538  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  51.33 
 
 
554 aa  534  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  51.36 
 
 
540 aa  525  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  52.38 
 
 
561 aa  527  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  54.77 
 
 
541 aa  526  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  52.82 
 
 
548 aa  523  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  50.29 
 
 
553 aa  523  1e-147  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  51.16 
 
 
545 aa  524  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  53.2 
 
 
554 aa  511  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  49.37 
 
 
559 aa  509  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  52.7 
 
 
549 aa  511  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.38 
 
 
530 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.46 
 
 
527 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  51.65 
 
 
550 aa  499  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  50.38 
 
 
548 aa  496  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.39 
 
 
529 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  49.5 
 
 
547 aa  490  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  49.81 
 
 
562 aa  490  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.98 
 
 
532 aa  488  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.94 
 
 
555 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.86 
 
 
536 aa  481  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  50.1 
 
 
554 aa  475  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  49.51 
 
 
558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  45.42 
 
 
558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.05 
 
 
537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  49.13 
 
 
560 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  48.93 
 
 
553 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  46.89 
 
 
528 aa  443  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.53 
 
 
546 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.69 
 
 
525 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.74 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.86 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.81 
 
 
528 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  41.09 
 
 
535 aa  388  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  38.86 
 
 
538 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  40.08 
 
 
550 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  40.78 
 
 
536 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  36.59 
 
 
527 aa  363  6e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  38.54 
 
 
553 aa  362  9e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  38.54 
 
 
553 aa  362  9e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  40 
 
 
541 aa  362  1e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  36.96 
 
 
559 aa  358  1.9999999999999998e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  38.45 
 
 
542 aa  355  8.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  38.51 
 
 
548 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  34.93 
 
 
567 aa  351  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  40 
 
 
535 aa  351  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  39.77 
 
 
548 aa  340  4e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.59 
 
 
570 aa  340  4e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.38 
 
 
529 aa  335  9e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  37.76 
 
 
527 aa  335  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  35.97 
 
 
536 aa  332  7.000000000000001e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  36 
 
 
553 aa  329  9e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  36.72 
 
 
551 aa  324  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  36.83 
 
 
533 aa  323  5e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  35.26 
 
 
560 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  36.73 
 
 
563 aa  320  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  36.1 
 
 
542 aa  320  5e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  36.26 
 
 
558 aa  318  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  36.12 
 
 
577 aa  317  4e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  35.38 
 
 
568 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  36.15 
 
 
530 aa  306  7e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  35.66 
 
 
539 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.9 
 
 
531 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.4 
 
 
523 aa  273  7e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  33.84 
 
 
552 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  31.04 
 
 
549 aa  270  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  31.03 
 
 
547 aa  269  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  32.28 
 
 
541 aa  268  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  35.24 
 
 
527 aa  267  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  32.13 
 
 
558 aa  266  7e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  31.22 
 
 
581 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  31.55 
 
 
546 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>