More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1792 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  66.8 
 
 		 540 aa  731    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  100 
 
 		 570 aa  1140    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  55.66 
 
 		 545 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  56.67 
 
 		 543 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  57.17 
 
 		 551 aa  590  1e-167  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  56.79 
 
 		 552 aa  591  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  54.04 
 
 		 542 aa  590  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  57.09 
 
 		 551 aa  589  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  54.79 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  55.19 
 
 		 553 aa  579  1e-164  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  54.73 
 
 		 551 aa  578  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  56.64 
 
 		 539 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  52.97 
 
 		 559 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  55.95 
 
 		 552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  54.01 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  53.35 
 
 		 543 aa  569  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  55.06 
 
 		 553 aa  570  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  51.74 
 
 		 558 aa  564  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  54.35 
 
 		 542 aa  561  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  51.86 
 
 		 554 aa  558  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  53.97 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  54.35 
 
 		 542 aa  558  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  54.19 
 
 		 562 aa  553  1e-156  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  53.15 
 
 		 543 aa  549  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  53.15 
 
 		 548 aa  545  1e-154  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  52.02 
 
 		 560 aa  545  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  52.61 
 
 		 560 aa  545  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  52.24 
 
 		 558 aa  541  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  51.24 
 
 		 547 aa  541  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  51.99 
 
 		 553 aa  543  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  52.94 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  51.91 
 
 		 563 aa  538  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  51.06 
 
 		 559 aa  538  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  51.53 
 
 		 543 aa  534  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  52.61 
 
 		 553 aa  528  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  53.15 
 
 		 554 aa  528  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  52.96 
 
 		 550 aa  523  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  52.66 
 
 		 549 aa  523  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  50.39 
 
 		 558 aa  524  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  48.8 
 
 		 557 aa  520  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  51.53 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  50.38 
 
 		 541 aa  505  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  50.19 
 
 		 558 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.81 
 
 		 530 aa  484  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.86 
 
 		 532 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  46.72 
 
 		 552 aa  476  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.61 
 
 		 527 aa  472  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  47.28 
 
 		 536 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.27 
 
 		 529 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  44.1 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  45.24 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  43.18 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  44.07 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  44.08 
 
 		 547 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.63 
 
 		 537 aa  419  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.2 
 
 		 555 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  42.91 
 
 		 528 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  38.84 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  41.88 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.61 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  40.33 
 
 		 550 aa  386  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  41.57 
 
 		 536 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  38.36 
 
 		 559 aa  383  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.76 
 
 		 525 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  40.42 
 
 		 548 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  41.41 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.19 
 
 		 528 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  37.26 
 
 		 527 aa  375  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.4 
 
 		 525 aa  373  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.46 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  39.89 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  36.55 
 
 		 567 aa  369  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  39.89 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  39.85 
 
 		 529 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  38.52 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  38.52 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  39.28 
 
 		 553 aa  363  4e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  40.41 
 
 		 548 aa  360  5e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  38.64 
 
 		 558 aa  358  9.999999999999999e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  37.74 
 
 		 542 aa  357  5e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  37.86 
 
 		 536 aa  355  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  39.14 
 
 		 533 aa  354  2.9999999999999997e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  36.4 
 
 		 570 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  35.68 
 
 		 560 aa  347  4e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  35.15 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  37.73 
 
 		 568 aa  342  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  34.6 
 
 		 577 aa  337  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  38.66 
 
 		 551 aa  336  5e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  35.8 
 
 		 530 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.8 
 
 		 531 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  35.21 
 
 		 523 aa  298  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  34.29 
 
 		 527 aa  284  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  34.92 
 
 		 526 aa  271  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  33.71 
 
 		 552 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  32.34 
 
 		 539 aa  258  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  30.77 
 
 		 558 aa  256  9e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  30.02 
 
 		 541 aa  251  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  29.25 
 
 		 547 aa  248  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  32.09 
 
 		 534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  32.09 
 
 		 534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>