More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA04280 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  74.52 
 
 		 531 aa  795    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  66.41 
 
 		 530 aa  708    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  64.08 
 
 		 527 aa  655    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  100 
 
 		 523 aa  1060    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  69.56 
 
 		 526 aa  731    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  34.71 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  34.83 
 
 		 542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  35.53 
 
 		 545 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  36.09 
 
 		 543 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  36.29 
 
 		 551 aa  303  6.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  35.28 
 
 		 570 aa  301  3e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  35.92 
 
 		 539 aa  299  9e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  35.49 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  35.47 
 
 		 563 aa  293  4e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  35.53 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  35.17 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  35.43 
 
 		 554 aa  290  4e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.56 
 
 		 551 aa  290  4e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  35.63 
 
 		 560 aa  290  6e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  35.43 
 
 		 558 aa  289  9e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  33.2 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  31.47 
 
 		 540 aa  287  4e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  33.98 
 
 		 558 aa  286  5.999999999999999e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  34.42 
 
 		 559 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  35.16 
 
 		 547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  34.48 
 
 		 554 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  34.83 
 
 		 557 aa  280  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  33.92 
 
 		 554 aa  280  4e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  35.64 
 
 		 542 aa  280  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  36.79 
 
 		 548 aa  280  6e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  35.16 
 
 		 553 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  36.08 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  33.85 
 
 		 570 aa  277  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  33.73 
 
 		 560 aa  277  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  34.2 
 
 		 558 aa  276  8e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  33.98 
 
 		 552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  35.25 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  33.4 
 
 		 543 aa  274  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  33.01 
 
 		 545 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  32.77 
 
 		 562 aa  273  7e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  32.78 
 
 		 542 aa  273  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  31.77 
 
 		 543 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  33.2 
 
 		 542 aa  272  9e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  34.82 
 
 		 541 aa  272  9e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  33.14 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  32.81 
 
 		 542 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  33.85 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  32.95 
 
 		 558 aa  269  8.999999999999999e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  34.25 
 
 		 560 aa  269  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  34.26 
 
 		 551 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  34.05 
 
 		 535 aa  265  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  32.68 
 
 		 559 aa  266  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  33.4 
 
 		 561 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  33.27 
 
 		 541 aa  264  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  32.46 
 
 		 553 aa  263  4.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.66 
 
 		 530 aa  262  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  36.01 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  33.4 
 
 		 552 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  36.27 
 
 		 550 aa  261  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.33 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  32.05 
 
 		 568 aa  261  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.97 
 
 		 555 aa  259  6e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.34 
 
 		 527 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  36.08 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  33.27 
 
 		 550 aa  257  5e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.64 
 
 		 529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  33.33 
 
 		 563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  33.08 
 
 		 527 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.72 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  33.66 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  32.31 
 
 		 548 aa  250  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  33.46 
 
 		 536 aa  249  6e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.45 
 
 		 536 aa  249  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  32.35 
 
 		 500 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  32.89 
 
 		 577 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  30.71 
 
 		 536 aa  247  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  31.52 
 
 		 528 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  32.76 
 
 		 548 aa  246  8e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  30.84 
 
 		 547 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.39 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  31.98 
 
 		 525 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  31.73 
 
 		 529 aa  239  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  30.5 
 
 		 533 aa  229  6e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  31.77 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  29.13 
 
 		 538 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.19 
 
 		 525 aa  219  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  30.23 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  30.23 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.13 
 
 		 528 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  29.42 
 
 		 519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  28.91 
 
 		 559 aa  206  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  27.01 
 
 		 527 aa  202  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  28.77 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  27.34 
 
 		 552 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  28.85 
 
 		 539 aa  193  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 		 567 aa  190  5e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  27.84 
 
 		 558 aa  190  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  27.9 
 
 		 547 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  27.88 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  27.88 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>