123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40956 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_40956  predicted protein  100 
 
 
529 aa  1081    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  45.07 
 
 
541 aa  423  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  42.99 
 
 
581 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  41.65 
 
 
549 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  44.08 
 
 
547 aa  396  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  32.05 
 
 
543 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  31.04 
 
 
545 aa  250  5e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  31.15 
 
 
543 aa  249  7e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  33.21 
 
 
543 aa  248  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  31.37 
 
 
542 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  31.18 
 
 
542 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  31.97 
 
 
557 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  31.43 
 
 
563 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  31.73 
 
 
542 aa  239  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  31.77 
 
 
558 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  31.4 
 
 
559 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  30.71 
 
 
551 aa  233  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  29.69 
 
 
555 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  32.03 
 
 
558 aa  232  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.98 
 
 
551 aa  229  9e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  31.09 
 
 
553 aa  228  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  30.18 
 
 
539 aa  226  6e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  31.41 
 
 
545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  30.41 
 
 
553 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  30.41 
 
 
553 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  30.98 
 
 
551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  30.35 
 
 
554 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  30.81 
 
 
559 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  30.55 
 
 
561 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.95 
 
 
546 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  31.26 
 
 
552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  30.92 
 
 
552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  29.9 
 
 
553 aa  210  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  28.28 
 
 
543 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  30.11 
 
 
562 aa  205  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  30.09 
 
 
542 aa  204  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  28.99 
 
 
560 aa  203  8e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  28.54 
 
 
558 aa  202  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  29 
 
 
559 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  29.55 
 
 
552 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  27.7 
 
 
538 aa  199  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  28.49 
 
 
500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.56 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.11 
 
 
530 aa  196  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  28.41 
 
 
547 aa  193  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  29.32 
 
 
548 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  26.49 
 
 
537 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  29.51 
 
 
551 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.13 
 
 
529 aa  192  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  27.57 
 
 
557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  28.25 
 
 
554 aa  190  7e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  28.82 
 
 
542 aa  189  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  25.76 
 
 
547 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  30 
 
 
550 aa  188  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  29.11 
 
 
558 aa  187  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.65 
 
 
536 aa  187  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.96 
 
 
528 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  27.22 
 
 
527 aa  186  9e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  28.08 
 
 
560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  27.19 
 
 
553 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  26.39 
 
 
532 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  29 
 
 
577 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  28.33 
 
 
541 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 
567 aa  183  8.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  28.19 
 
 
570 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  27.36 
 
 
548 aa  182  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  26.48 
 
 
535 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  27.65 
 
 
560 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  27.65 
 
 
558 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.77 
 
 
555 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  27.75 
 
 
554 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  27.29 
 
 
570 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.38 
 
 
525 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  25.77 
 
 
540 aa  177  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  28.99 
 
 
548 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  28.19 
 
 
553 aa  176  8e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  27.69 
 
 
548 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  27.51 
 
 
553 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  27.03 
 
 
563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  27.57 
 
 
528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  27.04 
 
 
536 aa  173  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  26.74 
 
 
527 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  26.53 
 
 
529 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  28.24 
 
 
525 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  28.57 
 
 
568 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  27.17 
 
 
554 aa  171  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  26.82 
 
 
541 aa  170  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  27.36 
 
 
549 aa  169  9e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  26.89 
 
 
533 aa  167  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  27.07 
 
 
535 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  24.67 
 
 
536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.31 
 
 
519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  26.4 
 
 
550 aa  164  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  25.82 
 
 
523 aa  159  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  26.5 
 
 
526 aa  152  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  24.37 
 
 
530 aa  151  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  26.43 
 
 
531 aa  146  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  27.17 
 
 
527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  25.14 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  27.24 
 
 
564 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>