11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_27987 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_66748  ATP-dependent DNA helicase  69.88 
 
 		 2159 aa  3072    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31130  ATP-dependent DNA helicase  87.47 
 
 		 2115 aa  3815    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31131  ATP-dependent DNA helicase  69.88 
 
 		 2159 aa  3072    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31132  ATP-dependent DNA helicase  83.56 
 
 		 1572 aa  1810    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33212  ATP-dependent DNA helicase  88.94 
 
 		 2110 aa  3888    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33214  predicted protein  71.18 
 
 		 451 aa  660    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33612  Vesicle coat complex AP-3  98.82 
 
 		 2116 aa  4372    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_27987  vesicle coat complex AP-3  100 
 
 		 2116 aa  4432    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.643082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_27988  vesicle coat complex AP-3  98.64 
 
 		 1323 aa  2741    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_27989  ATP-dependent DNA helicase  99.25 
 
 		 669 aa  1386    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67724  predicted protein  29.69 
 
 		 381 aa  164  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>