37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28388 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28388  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.706106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00390  expressed protein  35.53 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370664  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7434  predicted protein  29.41 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.34 
 
 		 138 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.81 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.81 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  33.01 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  26.81 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.81 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.81 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  26.81 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  28.17 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.47 
 
 		 136 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  24.63 
 
 		 140 aa  45.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  28.35 
 
 		 141 aa  45.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.09 
 
 		 140 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  26.09 
 
 		 140 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  29.45 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.32 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.32 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.32 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.32 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.32 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.87 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  28.57 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  25.87 
 
 		 137 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  23.94 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  25.87 
 
 		 137 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  25.87 
 
 		 137 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  25.36 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  30.23 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  25.9 
 
 		 137 aa  42  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  28.7 
 
 		 140 aa  42  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  29 
 
 		 138 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.12 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  27.01 
 
 		 139 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  26.12 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>