22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28162 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28162  Gamma tubulin  100 
 
 		 375 aa  775    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0897404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44225  predicted protein  37.2 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.768572  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00676  Tubulin gamma chain (Gamma-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18695]  36.39 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.372387  normal  0.509658 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00170  Tubulin gamma chain (Gamma tubulin), putative  36.94 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585998  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119480  gamma tubulin  36.46 
 
 		 449 aa  239  6.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171432  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03260  beta1-tubulin, putative  31.22 
 
 		 447 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00427493  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01182  Tubulin beta-1 chain (Beta-1-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10653]  29.52 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06838  Tubulin beta-2 chain (Beta-2-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10874]  29.13 
 
 		 449 aa  136  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21122  predicted protein  28.57 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84476  Tubulin beta chain (Beta tubulin)  28.46 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.08977 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00316  Tubulin alpha-1 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24633]  29.97 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0671525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12139  predicted protein  28.07 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28827  predicted protein  29.19 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54534  predicted protein  31.78 
 
 		 451 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02810  alpha tubulin, putative  31.32 
 
 		 448 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06670  Tubulin beta chain, putative  32.39 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.849819  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07570  Tubulin alpha-2 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24634]  30.26 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23506  normal  0.256932 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89181  Tubulin alpha chain  29.25 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  0.168385 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33239  predicted protein  30.46 
 
 		 452 aa  119  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00514267  normal  0.249426 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26788  predicted protein  29.89 
 
 		 447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.786535  hitchhiker  0.00567726 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10627  hypothetical protein  29.81 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.980847 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05082  Miscellaneous Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  23.28 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.797796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>