23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28287 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_28287  putative transporter or flippase transmembrane protein  100 
 
 
514 aa  1066    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61012  putative transporter or flippase transmembrane protein  43.9 
 
 
452 aa  359  7e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10947  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67900  putative transporter or flippase  34.29 
 
 
507 aa  286  5.999999999999999e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0276377  normal  0.165515 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04912  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10770)  35.97 
 
 
311 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825146  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02651  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 
296 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.673154 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02669  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11208  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17890)  28.89 
 
 
318 aa  107  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.939789 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00670  conserved hypothetical protein  31.34 
 
 
211 aa  99  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09111  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01970)  26.42 
 
 
295 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.956666  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05350  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14140)  29.82 
 
 
289 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000181467  hitchhiker  0.00389945 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03508  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01310)  26.1 
 
 
280 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07877  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17810)  22.9 
 
 
383 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08104  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01030)  24.73 
 
 
283 aa  67  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0651685 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29209  putative transporter or flippase transmembrane protein  24.83 
 
 
305 aa  65.1  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112208  normal  0.192439 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02100  integral to membrane protein, putative  27.66 
 
 
342 aa  63.9  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.60169  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03509  conserved hypothetical protein  23.33 
 
 
310 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02080  expressed protein  26.36 
 
 
354 aa  61.6  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389797  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02798  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 
136 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221186  normal  0.145812 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10770  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09550)  25.4 
 
 
301 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.867047  hitchhiker  0.00634456 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02342  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09900)  24.16 
 
 
297 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05100  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 
286 aa  51.6  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09374  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00920)  22.07 
 
 
281 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.191288 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40211  RTA protein  25.64 
 
 
269 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.147459  normal  0.195614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>