36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_26814 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_26814  predicted protein  100 
 
 
252 aa  510  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00061  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
237 aa  136  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0240751  normal  0.829799 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32818  predicted protein  36.52 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179933  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03090  expressed protein  35.83 
 
 
226 aa  93.2  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379491  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1703  hypothetical protein  35.45 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3916  hypothetical protein  33.64 
 
 
136 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1750  hypothetical protein  34.62 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377794  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0114  hypothetical protein  34.62 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2962  hypothetical protein  36.05 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0939229  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1126  hypothetical protein  34.58 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3986  hypothetical protein  33.61 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262813  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0412  hypothetical protein  31.86 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4148  hypothetical protein  29.32 
 
 
154 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2932  hypothetical protein  31.85 
 
 
153 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3831  hypothetical protein  29.91 
 
 
172 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1853  hypothetical protein  30.19 
 
 
183 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1444  hypothetical protein  33.64 
 
 
138 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.273597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00655  hypothetical protein  29.51 
 
 
135 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1823  hypothetical protein  28.97 
 
 
139 aa  52.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01610  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2206  transmembrane prediction  33.33 
 
 
113 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270827  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3098  hypothetical protein  24 
 
 
160 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4412  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91553  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2444  hypothetical protein  30.08 
 
 
154 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0338  hypothetical protein  36.14 
 
 
134 aa  48.5  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2950  hypothetical protein  30.97 
 
 
151 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.120168  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1501  hypothetical protein  31.76 
 
 
140 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522888  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1752  hypothetical protein  32.53 
 
 
120 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5229  hypothetical protein  32.94 
 
 
131 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183804  normal  0.664868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3114  hypothetical protein  29.25 
 
 
125 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749188  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3851  hypothetical protein  27.13 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0983307  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2516  hypothetical protein  30.89 
 
 
174 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0776456 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1466  hypothetical protein  27.71 
 
 
133 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.967848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5497  hypothetical protein  28.24 
 
 
130 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2739  hypothetical protein  30.89 
 
 
174 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1305  hypothetical protein  32.1 
 
 
169 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>