41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32818 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_32818  predicted protein  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179933  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00061  conserved hypothetical protein  43.71 
 
 
237 aa  145  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0240751  normal  0.829799 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26814  predicted protein  36.52 
 
 
252 aa  119  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03090  expressed protein  35.29 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379491  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0412  hypothetical protein  41.28 
 
 
176 aa  85.1  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3986  hypothetical protein  36.7 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00655  hypothetical protein  34.23 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3831  hypothetical protein  38.95 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2932  hypothetical protein  37.39 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2962  hypothetical protein  33.68 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0939229  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0338  hypothetical protein  38.89 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000351348  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1126  hypothetical protein  32.63 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3916  hypothetical protein  35 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4148  hypothetical protein  36.19 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1444  hypothetical protein  35.92 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.273597  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1935  hypothetical protein  33.9 
 
 
151 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.0079788  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1703  hypothetical protein  32.32 
 
 
117 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1853  hypothetical protein  33.68 
 
 
183 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5497  hypothetical protein  33.68 
 
 
130 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1750  hypothetical protein  33 
 
 
114 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377794  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0114  hypothetical protein  33 
 
 
114 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2950  hypothetical protein  35.85 
 
 
151 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.120168  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3098  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1823  hypothetical protein  34.62 
 
 
139 aa  62.4  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5229  hypothetical protein  34.07 
 
 
131 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183804  normal  0.664868 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01610  conserved hypothetical protein  34.45 
 
 
245 aa  60.1  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1466  hypothetical protein  39.76 
 
 
133 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.967848 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1501  hypothetical protein  31.87 
 
 
140 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522888  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1305  hypothetical protein  36.9 
 
 
169 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2206  transmembrane prediction  33.66 
 
 
113 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270827  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1752  hypothetical protein  40.79 
 
 
120 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4412  hypothetical protein  32.17 
 
 
153 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91553  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2444  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2516  hypothetical protein  23.87 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0776456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2739  hypothetical protein  23.87 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3114  hypothetical protein  35.64 
 
 
125 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749188  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34790  hypothetical protein  29.93 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.417258  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3265  hypothetical protein  32.67 
 
 
147 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.460792  decreased coverage  0.00938661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2150  hypothetical protein  31.71 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4322  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0257021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2214  hypothetical protein  30.63 
 
 
148 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>