41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3851 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3851  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  293  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0983307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1501  hypothetical protein  58.39 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522888  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3098  hypothetical protein  56.69 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4148  hypothetical protein  42.37 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4412  hypothetical protein  44 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91553  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3831  hypothetical protein  45.71 
 
 		 172 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1853  hypothetical protein  46.15 
 
 		 183 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1126  hypothetical protein  45.71 
 
 		 183 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2962  hypothetical protein  44.76 
 
 		 180 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0939229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3114  hypothetical protein  33.61 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2444  hypothetical protein  40.17 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2739  hypothetical protein  40.78 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2516  hypothetical protein  40.78 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1444  hypothetical protein  38.14 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.273597  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1703  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4322  hypothetical protein  40.45 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0257021 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1750  hypothetical protein  38.83 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0114  hypothetical protein  38.83 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0338  hypothetical protein  32.08 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000351348  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1823  hypothetical protein  35.14 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3916  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.80625 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107029 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5229  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183804  normal  0.664868 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1935  hypothetical protein  29.32 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.0079788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1305  hypothetical protein  32.14 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0412  hypothetical protein  31.63 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2206  transmembrane prediction  33.64 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2214  hypothetical protein  29.85 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2932  hypothetical protein  29.2 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3986  hypothetical protein  29.01 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00655  hypothetical protein  30.3 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2950  hypothetical protein  28.21 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.120168  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01610  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1979  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1466  hypothetical protein  29.55 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.967848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2150  hypothetical protein  35.63 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0483  hypothetical protein  22.81 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.344031  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00061  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 		 237 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0240751  normal  0.829799 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26814  predicted protein  27.13 
 
 		 252 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3635  hypothetical protein  29.63 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.455109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3265  hypothetical protein  35.8 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.460792  decreased coverage  0.00938661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>