30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1979 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1979  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  457  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0483  hypothetical protein  64.82 
 
 
212 aa  248  6e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.344031  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5497  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3986  hypothetical protein  35 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1444  hypothetical protein  34.48 
 
 
138 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.273597  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5229  hypothetical protein  35.14 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183804  normal  0.664868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1305  hypothetical protein  28.69 
 
 
169 aa  61.6  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3114  hypothetical protein  27.61 
 
 
125 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749188  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0338  hypothetical protein  28.3 
 
 
134 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2950  hypothetical protein  27.1 
 
 
151 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.120168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00655  hypothetical protein  31.63 
 
 
135 aa  58.9  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4148  hypothetical protein  29.03 
 
 
154 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2739  hypothetical protein  31.73 
 
 
174 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2516  hypothetical protein  31.73 
 
 
174 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0776456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2932  hypothetical protein  26.05 
 
 
153 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1501  hypothetical protein  29.59 
 
 
140 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522888  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2444  hypothetical protein  30.48 
 
 
154 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1853  hypothetical protein  27.56 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3851  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0983307  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2962  hypothetical protein  29.01 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0939229  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1823  hypothetical protein  25.22 
 
 
139 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1126  hypothetical protein  29.23 
 
 
183 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3098  hypothetical protein  26.53 
 
 
160 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1703  hypothetical protein  30.25 
 
 
117 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2206  transmembrane prediction  27.88 
 
 
113 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270827  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1935  hypothetical protein  24.53 
 
 
151 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.0079788  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01610  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3831  hypothetical protein  20.44 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4412  hypothetical protein  29.17 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91553  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4322  hypothetical protein  29.76 
 
 
164 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0257021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>