33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0483 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0483  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.344031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1979  hypothetical protein  64.82 
 
 		 224 aa  285  5e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1444  hypothetical protein  34.55 
 
 		 138 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.273597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2950  hypothetical protein  28.97 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.120168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3986  hypothetical protein  32 
 
 		 139 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262813  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5229  hypothetical protein  33.88 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183804  normal  0.664868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1305  hypothetical protein  30.48 
 
 		 169 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5497  hypothetical protein  29.82 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3114  hypothetical protein  29.2 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00655  hypothetical protein  28.95 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0338  hypothetical protein  25.74 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1501  hypothetical protein  32.97 
 
 		 140 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522888  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4148  hypothetical protein  27.5 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2932  hypothetical protein  26.32 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2739  hypothetical protein  32.69 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2516  hypothetical protein  32.69 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1823  hypothetical protein  30.36 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2444  hypothetical protein  30.48 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3098  hypothetical protein  29.82 
 
 		 160 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2206  transmembrane prediction  29.81 
 
 		 113 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3851  hypothetical protein  22.81 
 
 		 147 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0983307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1703  hypothetical protein  29.57 
 
 		 117 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4322  hypothetical protein  34.12 
 
 		 164 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0257021 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1935  hypothetical protein  24.53 
 
 		 151 aa  48.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.0079788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4412  hypothetical protein  28.47 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91553  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1853  hypothetical protein  29.09 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01610  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1126  hypothetical protein  25.81 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0412  hypothetical protein  25.23 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1750  hypothetical protein  30.86 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0114  hypothetical protein  30.86 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2962  hypothetical protein  27.56 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0939229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3831  hypothetical protein  23.02 
 
 		 172 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>