30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28240 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28240  RNA polymerase II subunit  100 
 
 		 173 aa  357  7e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.18212  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04750  conserved hypothetical protein  59.76 
 
 		 172 aa  217  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551706  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01521  RNA polymerase II subunit 7 (AFU_orthologue; AFUA_8G05300)  52.63 
 
 		 169 aa  192  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37948  predicted protein  48.84 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0428372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35680  predicted protein  41.52 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  27.81 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  27.81 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  27.15 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  24.84 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.32 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  27.33 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  21.02 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.67 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  26.49 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  23.57 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.33 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  26.81 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.82 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  19.46 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1136  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  29.17 
 
 		 211 aa  48.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.418303 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  30.66 
 
 		 206 aa  47.8  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.58 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  23.17 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.33 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15619  predicted protein  23.13 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.93 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.26 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01580  hypothetical protein  24 
 
 		 184 aa  40.8  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01447  DNA-directed RNA polymerase III subunit 22.9 kDa, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04350)  23.53 
 
 		 208 aa  41.2  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19835  predicted protein  28.85 
 
 		 208 aa  40.8  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.241408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>