More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1437 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  98.4 
 
 		 187 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  98.4 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  87.15 
 
 		 188 aa  323  1e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  69.52 
 
 		 195 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  50.56 
 
 		 194 aa  201  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  50.8 
 
 		 192 aa  198  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  52.54 
 
 		 206 aa  179  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  46.37 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.13 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  47.13 
 
 		 176 aa  169  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.13 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0728  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  46.24 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2396  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  43.65 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1391  DNA-directed RNA polymerase  49.44 
 
 		 180 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  42.29 
 
 		 188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.32 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  42.05 
 
 		 213 aa  157  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2207  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.32 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1488  DNA-directed RNA polymerase  44.75 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.462584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3454  DNA-directed RNA polymerase  45.86 
 
 		 191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0568  DNA-directed RNA polymerase  46.03 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.686614  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1136  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  38.92 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.418303 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.7 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.17 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.99 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  42.62 
 
 		 222 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1990  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  39.01 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04750  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551706  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  23.47 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  47.69 
 
 		 808 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  47.69 
 
 		 807 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  47.69 
 
 		 807 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  47.69 
 
 		 808 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  47.69 
 
 		 807 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  47.69 
 
 		 808 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  47.69 
 
 		 807 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  47.69 
 
 		 807 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15619  predicted protein  25.43 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28240  RNA polymerase II subunit  28 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.18212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  46.15 
 
 		 809 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  41.1 
 
 		 830 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  46.27 
 
 		 752 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  32.2 
 
 		 829 aa  62  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  41.1 
 
 		 834 aa  61.6  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  38.89 
 
 		 836 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  38.89 
 
 		 838 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19835  predicted protein  31.07 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  41.79 
 
 		 808 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  44.44 
 
 		 804 aa  60.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  37.23 
 
 		 828 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  44.62 
 
 		 817 aa  58.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35680  predicted protein  24.16 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  37.66 
 
 		 818 aa  58.5  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  39.44 
 
 		 833 aa  58.2  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  38.03 
 
 		 821 aa  57.8  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  36.17 
 
 		 819 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  39.44 
 
 		 771 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  39.44 
 
 		 770 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  38.67 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  35.16 
 
 		 758 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  41.03 
 
 		 880 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  38.3 
 
 		 763 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  40.91 
 
 		 762 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  39.19 
 
 		 814 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  28.38 
 
 		 819 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  41.1 
 
 		 777 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  39.44 
 
 		 749 aa  55.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  39.44 
 
 		 736 aa  55.8  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  38.67 
 
 		 722 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  37.33 
 
 		 829 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  41.54 
 
 		 824 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4617  ribonuclease R  42.25 
 
 		 826 aa  55.1  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  39.39 
 
 		 758 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  39.44 
 
 		 770 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  37.84 
 
 		 806 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  37.84 
 
 		 810 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  37.84 
 
 		 812 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  37.84 
 
 		 808 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  40 
 
 		 833 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0576  ribonuclease R  36.59 
 
 		 749 aa  55.1  0.0000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  37.84 
 
 		 806 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  37.5 
 
 		 842 aa  55.1  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  33.33 
 
 		 834 aa  55.1  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  39.13 
 
 		 808 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  39.13 
 
 		 804 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  39.13 
 
 		 808 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  39.13 
 
 		 806 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  39.13 
 
 		 792 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  34.83 
 
 		 735 aa  54.3  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  39.19 
 
 		 813 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  40.54 
 
 		 812 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  39.19 
 
 		 813 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  40.54 
 
 		 812 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  39.19 
 
 		 813 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  39.19 
 
 		 813 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  40.54 
 
 		 812 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  39.19 
 
 		 813 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  40.54 
 
 		 812 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  40.54 
 
 		 812 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>