More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1488 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1488  DNA-directed RNA polymerase  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.462584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3454  DNA-directed RNA polymerase  89.95 
 
 		 191 aa  319  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0728  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  82.35 
 
 		 192 aa  293  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2207  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  82.01 
 
 		 189 aa  289  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2396  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  76.72 
 
 		 191 aa  285  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  54.55 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  48.68 
 
 		 190 aa  194  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  45.95 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  45.95 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  48.86 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  49.43 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  46.86 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  52.25 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  44.89 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  43.75 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  43.75 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  42.46 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  40.22 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0568  DNA-directed RNA polymerase  39.2 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.686614  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  34.92 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.63 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1391  DNA-directed RNA polymerase  33.15 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.46 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  34.07 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  33.15 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1136  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  30.73 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.418303 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1990  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  34.07 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  33.51 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  38.46 
 
 		 752 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  23.91 
 
 		 779 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.34 
 
 		 720 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37948  predicted protein  25.99 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0428372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04750  conserved hypothetical protein  29.81 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551706  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  30.84 
 
 		 801 aa  55.5  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.29 
 
 		 716 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.382985  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  27.01 
 
 		 770 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  26.62 
 
 		 762 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  32 
 
 		 833 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  28.81 
 
 		 774 aa  53.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  32.43 
 
 		 834 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  30.67 
 
 		 829 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  29.55 
 
 		 758 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 718 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  29.79 
 
 		 818 aa  52.4  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  32.61 
 
 		 819 aa  52  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0484  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 715 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.102378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  28.16 
 
 		 801 aa  52  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  27.34 
 
 		 810 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  27.27 
 
 		 771 aa  51.6  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0035  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.4 
 
 		 748 aa  52  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  30.56 
 
 		 770 aa  51.6  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0436  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.48 
 
 		 722 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  34.72 
 
 		 842 aa  51.2  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  29.58 
 
 		 808 aa  51.6  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3192  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  32.29 
 
 		 715 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.002791  normal  0.0369352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  34.62 
 
 		 813 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  34.62 
 
 		 813 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  29.41 
 
 		 880 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  34.62 
 
 		 813 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  34.62 
 
 		 813 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  30.67 
 
 		 746 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  34.62 
 
 		 813 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35680  predicted protein  23.43 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  34.62 
 
 		 813 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0605  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32 
 
 		 718 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  33.7 
 
 		 818 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  30.67 
 
 		 746 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0227  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.48 
 
 		 722 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133448  normal  0.547858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  27.01 
 
 		 792 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  34.62 
 
 		 813 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  34.62 
 
 		 813 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  34.62 
 
 		 813 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  33.7 
 
 		 818 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0288  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.4 
 
 		 730 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0388227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.11 
 
 		 714 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0966  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.26 
 
 		 699 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000874082  normal  0.0188392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  27.45 
 
 		 822 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  33.33 
 
 		 903 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  26.28 
 
 		 806 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  25.74 
 
 		 824 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  35.63 
 
 		 382 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  32.61 
 
 		 828 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1209  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.73 
 
 		 702 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  35.63 
 
 		 382 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  26.28 
 
 		 808 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  35.63 
 
 		 382 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  26.28 
 
 		 804 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  35.63 
 
 		 382 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  35.63 
 
 		 382 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  35.63 
 
 		 382 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  26.28 
 
 		 808 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  33.33 
 
 		 812 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  33.33 
 
 		 812 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  28.35 
 
 		 824 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  28 
 
 		 807 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  32.88 
 
 		 751 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  32.88 
 
 		 751 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  33.33 
 
 		 812 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  33.33 
 
 		 812 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  28 
 
 		 807 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>