More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1391 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1391  DNA-directed RNA polymerase  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  61.27 
 
 		 176 aa  243  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  50 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  49.43 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  49.43 
 
 		 187 aa  181  7e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  47.19 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  47.22 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1136  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  39.13 
 
 		 211 aa  160  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.418303 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  38.98 
 
 		 198 aa  158  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  42.62 
 
 		 194 aa  157  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  43.17 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  43.17 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  41.9 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  46.11 
 
 		 222 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  38.8 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  43.17 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1990  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  41.44 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  40.11 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.22 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.08 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.07 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.08 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0568  DNA-directed RNA polymerase  35.42 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.686614  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2396  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  34.83 
 
 		 191 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0728  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  34.97 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2207  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  35.52 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1488  DNA-directed RNA polymerase  33.15 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.462584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3454  DNA-directed RNA polymerase  33.89 
 
 		 191 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  30.2 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19835  predicted protein  32.04 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.241408  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1314  RNA binding S1  35.96 
 
 		 773 aa  60.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.207227 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  34.78 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1161  RNA binding S1  37.08 
 
 		 784 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.140399  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01521  RNA polymerase II subunit 7 (AFU_orthologue; AFUA_8G05300)  23.84 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15619  predicted protein  23.53 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  31.93 
 
 		 818 aa  55.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09151  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  39.71 
 
 		 760 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000238472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  46.27 
 
 		 598 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14471  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  34.83 
 
 		 796 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  35.11 
 
 		 382 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 		 382 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 		 382 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  35.48 
 
 		 382 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  34.04 
 
 		 382 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 		 382 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37948  predicted protein  21.35 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0428372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  38.03 
 
 		 817 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  34.04 
 
 		 382 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 		 382 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  38.36 
 
 		 812 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  41.54 
 
 		 762 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  38.57 
 
 		 806 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  38.57 
 
 		 806 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  38.57 
 
 		 808 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  38.57 
 
 		 804 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  38.57 
 
 		 810 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  38.57 
 
 		 806 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 		 382 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  38.57 
 
 		 808 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  36.62 
 
 		 735 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  38.57 
 
 		 792 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  38.36 
 
 		 808 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  32.98 
 
 		 382 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  34.74 
 
 		 416 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  40.85 
 
 		 833 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  35.11 
 
 		 382 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  38.36 
 
 		 814 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  40.85 
 
 		 819 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  40 
 
 		 758 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0576  ribonuclease R  38.03 
 
 		 749 aa  52  0.000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  40.85 
 
 		 828 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  41.67 
 
 		 562 aa  51.6  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  40.85 
 
 		 824 aa  51.6  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  39.44 
 
 		 826 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  37 
 
 		 587 aa  51.2  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  39.44 
 
 		 819 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  39.44 
 
 		 818 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  39.44 
 
 		 818 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  38.03 
 
 		 808 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01580  hypothetical protein  27.17 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  33.7 
 
 		 804 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  38.03 
 
 		 808 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  38.03 
 
 		 808 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  36.62 
 
 		 829 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  39.44 
 
 		 808 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3646  exoribonuclease R  39.44 
 
 		 844 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  35.19 
 
 		 778 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3791  exoribonuclease R  39.44 
 
 		 844 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0953  RNA binding S1  33.82 
 
 		 739 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0692  exoribonuclease R  39.44 
 
 		 844 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  30.91 
 
 		 399 aa  49.3  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  36.62 
 
 		 809 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  36.92 
 
 		 792 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04750  conserved hypothetical protein  22.09 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0240  RNA binding S1 domain protein  38.55 
 
 		 780 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  29.9 
 
 		 396 aa  48.9  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0320  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 		 775 aa  48.5  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  28.42 
 
 		 387 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10221  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  33.82 
 
 		 740 aa  48.5  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  36.36 
 
 		 752 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>