33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_37948 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009364  OSTLU_37948  predicted protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0428372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04750  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551706  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28240  RNA polymerase II subunit  48.84 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.18212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35680  predicted protein  41.44 
 
 		 181 aa  137  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01521  RNA polymerase II subunit 7 (AFU_orthologue; AFUA_8G05300)  35.09 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.32 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  23.42 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  23.42 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  22.15 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  26.8 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.16 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  22.15 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.16 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.52 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  27.27 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  19.62 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.95 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2396  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.74 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  23.87 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.03 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.84 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3454  DNA-directed RNA polymerase  29.03 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  24.68 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.16 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25.56 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  21.15 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0728  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  26.62 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2207  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  27.74 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  19.35 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1488  DNA-directed RNA polymerase  25.99 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.462584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1391  DNA-directed RNA polymerase  21.35 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01447  DNA-directed RNA polymerase III subunit 22.9 kDa, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04350)  21.14 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0568  DNA-directed RNA polymerase  25 
 
 		 199 aa  40.8  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.686614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>