18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28128 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_28128  predicted protein  100 
 
 
290 aa  594  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.401737  normal  0.0860362 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05906  U-box domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11040)  37.37 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1443  hypothetical protein  34.57 
 
 
1053 aa  57  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.639099 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86132  predicted protein  36.99 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.279503  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28133  predicted protein  34.74 
 
 
940 aa  55.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.096306 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0377  hypothetical protein  33.8 
 
 
935 aa  54.3  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.750713 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36517  predicted protein  32.5 
 
 
170 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0130475  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10556  ubiquitin chain assembly factor (Eurofung)  34.94 
 
 
1095 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9923  predicted protein  33.82 
 
 
68 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2887  hypothetical protein  35.21 
 
 
240 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31475  predicted protein  40 
 
 
255 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.73 
 
 
961 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45922  predicted protein  32.05 
 
 
1121 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04300  hypothetical protein  37.14 
 
 
1175 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.14655  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  28.38 
 
 
789 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64503  predicted protein  28.57 
 
 
1046 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  31.75 
 
 
821 aa  42.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  30.43 
 
 
723 aa  42.4  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>