23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36517 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_36517  predicted protein  100 
 
 
170 aa  348  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0130475  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9923  predicted protein  42.65 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86132  predicted protein  38.46 
 
 
258 aa  67  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.279503  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46537  predicted protein  40 
 
 
197 aa  58.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.197713  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35.38 
 
 
552 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.38 
 
 
789 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.38 
 
 
961 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1443  hypothetical protein  28.95 
 
 
1053 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.639099 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  32.39 
 
 
821 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  35.38 
 
 
1585 aa  52.4  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0451  hypothetical protein  32.86 
 
 
1071 aa  52.4  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28128  predicted protein  32.5 
 
 
290 aa  51.6  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.401737  normal  0.0860362 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0377  hypothetical protein  35.82 
 
 
935 aa  49.3  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.750713 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  33.85 
 
 
723 aa  49.7  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05906  U-box domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11040)  38.71 
 
 
293 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45460  predicted protein  36.11 
 
 
576 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50220  predicted protein  36.11 
 
 
576 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32661  predicted protein  34.72 
 
 
595 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.373889 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27375  predicted protein  29.35 
 
 
537 aa  42.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64503  predicted protein  34.29 
 
 
1046 aa  42  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2887  hypothetical protein  22.45 
 
 
240 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04300  hypothetical protein  32.88 
 
 
1175 aa  41.6  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.14655  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28133  predicted protein  35.38 
 
 
940 aa  41.2  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.096306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>