34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_23779 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  100 
 
 		 85 aa  170  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  74.16 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  56.58 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  53.95 
 
 		 622 aa  83.6  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  49.38 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24886  predicted protein  45.24 
 
 		 200 aa  72  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11286  predicted protein  42.47 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673219  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_31946  predicted protein  48.61 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04220  nonhistone protein 6, putative  38.36 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219393  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6025  predicted protein  37.68 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8737  predicted protein  36.9 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28032  predicted protein  35 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307251  normal  0.690356 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11888  predicted protein  39.71 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_12709  non-histone protein 10  37.04 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0597181  normal  0.318516 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49362  predicted protein  38.54 
 
 		 363 aa  54.7  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04270  HMG1, putative  43.59 
 
 		 895 aa  53.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8293  predicted protein  36.36 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261869  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45968  predicted protein  41.67 
 
 		 304 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19125  predicted protein  46.94 
 
 		 543 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25566  predicted protein  36.92 
 
 		 338 aa  50.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43419  predicted protein  34.09 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.52566  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33840  predicted protein  33.96 
 
 		 400 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15773  predicted protein  43.4 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0565189 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66957  high mobility group-like protein  29.89 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37272  predicted protein  33.77 
 
 		 351 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49506  predicted protein  29.36 
 
 		 506 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00216609  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16581  predicted protein  37.5 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32993  predicted protein  34.38 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161398  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47778  predicted protein  33.78 
 
 		 777 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.950731  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46740  predicted protein  33.82 
 
 		 338 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34626  predicted protein  32.5 
 
 		 287 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000196337  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39880  predicted protein  32.5 
 
 		 287 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01267  HMG box protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10040)  34.92 
 
 		 326 aa  41.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150456 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01962  HMG box transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10820)  29.73 
 
 		 675 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>