10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_27989 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_66748  ATP-dependent DNA helicase  74.74 
 
 		 2159 aa  1036    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31130  ATP-dependent DNA helicase  84.73 
 
 		 2115 aa  1179    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31131  ATP-dependent DNA helicase  74.74 
 
 		 2159 aa  1036    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31132  ATP-dependent DNA helicase  83.71 
 
 		 1572 aa  1165    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33212  ATP-dependent DNA helicase  89.54 
 
 		 2110 aa  1255    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33214  predicted protein  71.49 
 
 		 451 aa  662    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33612  Vesicle coat complex AP-3  98.51 
 
 		 2116 aa  1377    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_27987  vesicle coat complex AP-3  99.25 
 
 		 2116 aa  1386    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.643082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_27989  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 669 aa  1400    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67724  predicted protein  29.69 
 
 		 381 aa  163  7e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>