72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28000 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_28000  Fungal-specific transcription factor  100 
 
 
858 aa  1778    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395949  normal  0.0721946 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53992  CYP1/HAP1-like protein  29.36 
 
 
758 aa  301  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88209  Fungal specific transcription factor  25.95 
 
 
1028 aa  228  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0520649  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56468  Fungal transcriptional regulatory protein  27.72 
 
 
876 aa  224  4e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753603  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_935  Fungal transcriptional regulatory protein  24.26 
 
 
760 aa  206  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.664373 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82123  Fungal transcriptional regulatory protein  25.78 
 
 
1080 aa  198  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.600944 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76670  Fungal transcriptional regulatory protein  26.09 
 
 
1026 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81861  Fungal transcriptional regulatory protein  26.44 
 
 
1095 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518071  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30770  Fungal transcriptional regulatory protein  24.45 
 
 
759 aa  178  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00132045  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29444  Fungal specific transcription factor  25.43 
 
 
1135 aa  136  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31115  zinc finger transcription factor  24.76 
 
 
765 aa  119  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56968  positive regulator of cytochrome C genes CYC1 and CYC7  23.7 
 
 
1085 aa  82.4  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.489386 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_622  CAT8 controls the key enzymes of gluconeogenesis  52.27 
 
 
1009 aa  57.8  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00677411  normal  0.437282 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11003  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  32.76 
 
 
847 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.824231  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06091  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  52.27 
 
 
734 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0514729 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31755  predicted protein  55.26 
 
 
1086 aa  55.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.115021 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02852  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  46.67 
 
 
1018 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06396  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  21.92 
 
 
772 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00359431  normal  0.0434138 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01518  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  39.39 
 
 
825 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650204  normal  0.31742 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04118  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.82 
 
 
559 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62477  fungal specific zinc-finger transcription factor  48.08 
 
 
882 aa  52.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.183174  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47398  zinc finger transcription factor of the Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain type  46.67 
 
 
800 aa  51.6  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.654245  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01641  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  45.45 
 
 
681 aa  51.2  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293594  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02660  transcriptional regulatory protein, putative  21.17 
 
 
927 aa  51.2  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00689  Acetate regulatory DNA binding protein FacBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13461]  31.18 
 
 
867 aa  51.2  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04837  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  39.66 
 
 
684 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355797  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00533  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.9 
 
 
641 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.868926 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77168  transcriptional regulator  40.43 
 
 
907 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00388  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.88 
 
 
825 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02324  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.49 
 
 
832 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01134  Quinic acid utilization activator [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10563]  46.67 
 
 
825 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.524826  normal  0.226407 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08885  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  46.67 
 
 
915 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.50205  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06846  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.36 
 
 
681 aa  48.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02820  nucleus protein, putative  31.91 
 
 
1138 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.230984  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60634  STB4; binds Sin3p in two-hybrid assay  47.5 
 
 
742 aa  47.8  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279856  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07610  Putative transcription factor [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J128]  37.78 
 
 
875 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08506  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  31.58 
 
 
768 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.359432  normal  0.0268522 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10504  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.5 
 
 
811 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141507  normal  0.456336 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03835  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  47.37 
 
 
594 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.821404  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08391  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  38.18 
 
 
479 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0317347  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02730  expressed protein  23.5 
 
 
1142 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33076  predicted protein  30.3 
 
 
648 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.759857  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57167  Fungal specific transcription factor  29.76 
 
 
713 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.256805  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08355  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  51.35 
 
 
526 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08441  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.86 
 
 
749 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.739366  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02241  putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.86 
 
 
583 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.590542  normal  0.709701 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66925  predicted protein  30.47 
 
 
1062 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03930  hypothetical protein  35.71 
 
 
738 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00197  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  31.13 
 
 
638 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189887 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11793  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.99 
 
 
541 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.617651  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03900  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  26.92 
 
 
729 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374143 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08590  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.32 
 
 
953 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08894  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  27.59 
 
 
871 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487487  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10638  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  39.29 
 
 
759 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0597746  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37775  Fungal transcriptional regulatory protein  51.06 
 
 
937 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.709365  normal  0.204154 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09025  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  35 
 
 
891 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08535  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  35.85 
 
 
560 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.414423 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28111  Zn-finger protein  43.9 
 
 
924 aa  45.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.689755 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01820  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.99 
 
 
1030 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08414  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  31.48 
 
 
730 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.849595 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_15419  predicted protein  48.57 
 
 
714 aa  44.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0198581  normal  0.726976 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10105  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  45.95 
 
 
1119 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227022  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04558  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.18 
 
 
854 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00100  hypothetical protein  21.8 
 
 
701 aa  44.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.519073  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11185  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  26.98 
 
 
779 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.298239 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33678  predicted protein  36.14 
 
 
673 aa  44.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07379  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  47.5 
 
 
742 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00853  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  24.18 
 
 
678 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_13001  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.89 
 
 
614 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102904  normal  0.339572 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07346  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  43.24 
 
 
584 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.545728  normal  0.644671 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03390  nucleus protein, putative  41.38 
 
 
938 aa  44.3  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.175447  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10491  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  37.5 
 
 
759 aa  44.3  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>