More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_2658 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_2658  NAD-dependent histone deacetylase  100 
 
 		 425 aa  870    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.755641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40594  NAD-dependent histone deacetylase SIR2 (Regulatory protein SIR2) (Silent information regulator 2)  48.92 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.326026 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10449  histone deacetylase (Eurofung)  41.26 
 
 		 489 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02940  histone deacetylase, putative  38.44 
 
 		 596 aa  265  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211109  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07461  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05900)  36.39 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.12277 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16859  predicted protein  39.35 
 
 		 264 aa  176  9e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04320  NAD-dependent histone deacetylase, putative  40.34 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32025  putative histone deacetylase-like protein  35.38 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.822239  normal  0.176883 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16771  predicted protein  39.91 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0241463 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08450  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00520)  32.18 
 
 		 2081 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.601211 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8827  predicted protein  40 
 
 		 219 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49645  NAD-dependent deacetylase HST3 (Homologous to SIR2 protein 3)  30.38 
 
 		 342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838214  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12305  predicted protein  30.32 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  33.63 
 
 		 248 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  32.92 
 
 		 256 aa  114  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  33.48 
 
 		 278 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 251 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03250  hst3 protein, putative  33.33 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  27.68 
 
 		 250 aa  111  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 266 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  30.5 
 
 		 244 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  30.5 
 
 		 244 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  30.86 
 
 		 256 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  33.63 
 
 		 253 aa  107  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  29.1 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  31.78 
 
 		 253 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45850  silent information regulator protein Sir2  29.25 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  31.71 
 
 		 254 aa  103  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  33.07 
 
 		 247 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  33.97 
 
 		 231 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  31.65 
 
 		 246 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  28.4 
 
 		 248 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  30.68 
 
 		 253 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 256 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  26.88 
 
 		 252 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  29.12 
 
 		 251 aa  98.6  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  30 
 
 		 245 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  32.07 
 
 		 249 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  29.44 
 
 		 252 aa  97.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  29.95 
 
 		 257 aa  96.7  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  29.92 
 
 		 261 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01226  SIR2 family histone deacetylase (Hst4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10540)  29.24 
 
 		 595 aa  96.7  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  32.94 
 
 		 250 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  28.82 
 
 		 252 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  34.58 
 
 		 244 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  26.8 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  29.45 
 
 		 245 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  29.45 
 
 		 245 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  28.41 
 
 		 254 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  29.58 
 
 		 251 aa  94  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  29.96 
 
 		 242 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  27.53 
 
 		 242 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  27.73 
 
 		 236 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  27.53 
 
 		 245 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  29.2 
 
 		 246 aa  92  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  27.4 
 
 		 242 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  28.57 
 
 		 250 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  29.28 
 
 		 256 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  28.89 
 
 		 241 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  26.5 
 
 		 259 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  29.32 
 
 		 234 aa  90.5  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  28.47 
 
 		 241 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  28.15 
 
 		 242 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  28.33 
 
 		 242 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  29.03 
 
 		 238 aa  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  26.64 
 
 		 244 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  28.89 
 
 		 245 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  28.69 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  29.2 
 
 		 242 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  27.02 
 
 		 259 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  29.49 
 
 		 248 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  28.45 
 
 		 253 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  28 
 
 		 248 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04500  hst4 protein, putative  25.96 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  28.17 
 
 		 251 aa  86.7  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  28.51 
 
 		 247 aa  86.3  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  28.05 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  28.26 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  30.56 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  29.07 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  29.83 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0337  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  29.85 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00956339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1797  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  28.97 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  27.16 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  27.98 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  27.2 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  27.84 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  30.04 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  28.25 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  27.49 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  27.13 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  28.05 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  24.37 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  26.49 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  25.78 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  26.5 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  24.37 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  24.37 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  26.34 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  27.17 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>